RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638692.1

PTPRVP-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRVP, Length 1,189 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-203ENST00000638692 MPEG1Q2M385 716 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 ZNF628Q5EBL2 1059 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 PIGGQ5H8A4 983 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 LYPD8Q6UX82 237 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 MDGA2Q7Z553 956 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 VWA5B2Q8N398 1253 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 TMEM156Q8N614 296 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 ZNF441Q8N8Z8 693 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 OR5L2Q8NGL0 311 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 CLHC1Q8NHS4 586 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 PPP1R36Q96LQ0 422 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 PPP3R2Q96LZ3 170 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 WWTR1Q9GZV5 400 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 OR10A5Q9H207 317 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 ANKRA2Q9H9E1 313 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 MAP10Q9P2G4 905 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 DTX4Q9Y2E6 619 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 ZGRF1Q86YA3 2104 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 OR6C76A6NM76 312 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 TCP11X1B4DZS4 312 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 AKAP10O43572 662 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 SLC25A12O75746 678 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 WISP2O76076 250 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 LRATO95237 230 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 WISP1O95388 367 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 PMP22Q01453 160 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 ZNF385BQ569K4 471 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 SLC25A25Q6KCM7 469 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 IL20RBQ6UXL0 311 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 SLC29A4Q7RTT9 530 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 OR7G1Q8NGA0 311 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 OR9A2Q8NGT5 310 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 C16orf52Q8NHV5 167 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 ZNF675Q8TD23 568 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 ASB15Q8WXK1 588 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 KAT2AQ92830 837 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 ADIPOR1Q96A54 375 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 TUBGCP3Q96CW5 907 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 C1orf50Q9BV19 199 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 MANSC1Q9H8J5 431 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 PFDN4Q9NQP4 134 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-203ENST00000638692 NME2P1O60361 137 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 CD46P15529 392 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 NME2P22392 152 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 OCRLQ01968 901 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 PDE7AQ13946 482 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 INAQ16352 499 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 MAPKAPK3Q16644 382 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 FHL5Q5TD97 284 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 IL23RQ5VWK5 629 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 LIX1Q8N485 282 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 HORMAD2Q8N7B1 307 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 NUDT8Q8WV74 236 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 FAR1Q8WVX9 515 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 GAL3ST4Q96RP7 486 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 GLIPR2Q9H4G4 154 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 REEP4Q9H6H4 257 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 AKTIPQ9H8T0 292 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 MIEF1Q9NQG6 463 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 THAP1Q9NVV9 213 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 ENTPD4Q9Y227 616 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 FLNCQ14315 2725 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 ESPL1Q14674 2120 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 TBX19O60806 448 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 NME6O75414 186 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 RASAL1O95294 804 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 GPX3P22352 226 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 MPIP34949 423 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 UQCRFS1P47985 274 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 EMDP50402 254 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 PTGR1Q14914 329 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 FNDC5Q8NAU1 212 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 GALNT11Q8NCW6 608 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 OR7G2Q8NG99 324 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 OR52R1Q8NGF1 315 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 C5orf34Q96MH7 638 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 AMDHD1Q96NU7 426 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 BBS4Q96RK4 519 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 NUF2Q9BZD4 464 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 DEPPQ9NTK1 212 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 GIMAP4Q9NUV9 329 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 BCAP29Q9UHQ4 241 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 NINQ8N4C6 2090 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 ASPDHA6ND91 283 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRVP-203ENST00000638692 A8MVJ9 347 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms