RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
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SGMS1-210ENST00000619438 LINC01555Q8NAE3 123 aa20.29■□□□□ 0.84
SGMS1-210ENST00000619438 OR2L8Q8NGY9 312 aa20.29■□□□□ 0.84
SGMS1-210ENST00000619438 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SGMS1-210ENST00000619438 SMPDL3AQ92484 453 aa20.29■□□□□ 0.84
SGMS1-210ENST00000619438 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
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SGMS1-210ENST00000619438 SERTAD3Q9UJW9 196 aa20.29■□□□□ 0.84
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SGMS1-210ENST00000619438 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
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SGMS1-210ENST00000619438 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
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SGMS1-210ENST00000619438 CDH15P55291 814 aa20.26■□□□□ 0.83
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SGMS1-210ENST00000619438 C11orf65Q8NCR3 313 aa20.26■□□□□ 0.83
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SGMS1-210ENST00000619438 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa20.26■□□□□ 0.83
SGMS1-210ENST00000619438 TAC3Q9UHF0 121 aa20.26■□□□□ 0.83
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SGMS1-210ENST00000619438 SLC16A6O15403 523 aa20.25■□□□□ 0.83
SGMS1-210ENST00000619438 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SGMS1-210ENST00000619438 FABP3P05413 133 aa20.25■□□□□ 0.83
SGMS1-210ENST00000619438 KLK1P06870 262 aa20.25■□□□□ 0.83
SGMS1-210ENST00000619438 LIFP15018 202 aa20.25■□□□□ 0.83
SGMS1-210ENST00000619438 GSTM5P46439 218 aa20.25■□□□□ 0.83
SGMS1-210ENST00000619438 RAD23AP54725 363 aa20.25■□□□□ 0.83
SGMS1-210ENST00000619438 TAS2R50P59544 299 aa20.25■□□□□ 0.83
SGMS1-210ENST00000619438 HBA1P69905 142 aa20.25■□□□□ 0.83
SGMS1-210ENST00000619438 FADDQ13158 208 aa20.25■□□□□ 0.83
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