RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, human

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGEF1-209	ENST00000607882	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	SGPP1	Q9BX95	441 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	NLN	Q9BYT8	704 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	DERL2	Q9GZP9	239 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	C4orf51	C9J302	202 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	RDH16	O75452	317 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	UMOD	P07911	640 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	MYF6	P23409	242 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	GSK3B	P49841	420 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	CLC	Q05315	142 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	NFYC	Q13952	458 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	CARF	Q8N187	725 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR56A3	Q8NH54	315 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	CDK15	Q96Q40	435 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	ING2	Q9H160	280 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	ALG2	Q9H553	416 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	GID8	Q9NWU2	228 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	OARD1	Q9Y530	152 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	FOXS1	O43638	330 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	ENTPD1	P49961	510 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	LCP2	Q13094	533 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLC36A3	Q495N2	470 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	11.79	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	FBXL8	Q96CD0	374 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	C1orf50	Q9BV19	199 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	USP22	Q9UPT9	525 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	11.79	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	ACOX3	O15254	700 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	CLOCK	O15516	846 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	CELA2A	P08217	269 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	GSTT2	P0CG29	244 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	GSTT2B	P0CG30	244 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	IDO1	P14902	403 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	AP1S2	P56377	157 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	11.79	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	ATP6AP1	Q15904	470 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	NKG7	Q16617	165 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR8K5	Q8NH50	307 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	SEPHS2	Q99611	448 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	MFRP	Q9BY79	579 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	ASPDH	A6ND91	283 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	CD22	P20273	847 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	CCR8	P51685	355 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	LIPE	Q05469	1076 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZBED5	Q49AG3	693 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	GPR180	Q86V85	440 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	TRPV3	Q8NET8	790 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLC16A5	O15375	505 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	RASAL1	O95294	804 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	FOLR3	P41439	243 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	PLA2G16	P53816	162 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	KCNK10	P57789	538 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	UFM1	P61960	85 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	HYAL2	Q12891	473 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	XKR6	Q5GH73	641 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	CFAP161	Q6P656	301 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	AMER3	Q8N944	861 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52

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