RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577426.1

TRAPPC8-202, Transcript of trafficking protein particle complex 8, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC8, Length 437 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8-202ENST00000577426 RBPJQ06330 500 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 RGS1Q08116 209 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 NFYCQ13952 458 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 CSHL1Q14406 222 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 OR1C1Q15619 314 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 DEFB134Q4QY38 66 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 KRTCAP3Q53RY4 240 aa4.7□□□□□ -1.66
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TRAPPC8-202ENST00000577426 ABHD13Q7L211 337 aa4.7□□□□□ -1.66
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TRAPPC8-202ENST00000577426 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 PDIK1LQ8N165 341 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 KIF2BQ8N4N8 673 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 TBC1D19Q8N5T2 526 aa4.7□□□□□ -1.66
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TRAPPC8-202ENST00000577426 GPATCH11Q8N954 259 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 ANKRD53Q8N9V6 530 aa4.7□□□□□ -1.66
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TRAPPC8-202ENST00000577426 OR14K1Q8NGZ2 314 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 CREB3L4Q8TEY5 395 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 TSLPQ969D9 159 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 CFAP36Q96G28 342 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 GPR137Q96N19 417 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 TSNARE1Q96NA8 513 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 SH3GL2Q99962 352 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
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TRAPPC8-202ENST00000577426 TRIM54Q9BYV2 358 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 SPNS1Q9H2V7 528 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 KLHL31Q9H511 634 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 PELI2Q9HAT8 420 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 MED4Q9NPJ6 270 aa4.7□□□□□ -1.66
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TRAPPC8-202ENST00000577426 ANKRD10Q9NXR5 420 aa4.7□□□□□ -1.66
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TRAPPC8-202ENST00000577426 EDARQ9UNE0 448 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 CHMP2BQ9UQN3 213 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF835Q9Y2P0 537 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 RTTNQ86VV8 2226 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 URADA6NGE7 173 aa4.69□□□□□ -1.66
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TRAPPC8-202ENST00000577426 C4orf51C9J302 202 aa4.69□□□□□ -1.66
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TRAPPC8-202ENST00000577426 MLYCDO95822 493 aa4.69□□□□□ -1.66
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TRAPPC8-202ENST00000577426 HNMTP50135 292 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 CASP6P55212 293 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 MLF1P58340 268 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 TAS2R39P59534 338 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 TAS2R50P59544 299 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 RAB8AP61006 207 aa4.69□□□□□ -1.66
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TRAPPC8-202ENST00000577426 ADORA2A-AS1P86434 159 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
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TRAPPC8-202ENST00000577426 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 C3AR1Q16581 482 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 SLC25A25Q6KCM7 469 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 XKRXQ6PP77 449 aa4.69□□□□□ -1.66
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TRAPPC8-202ENST00000577426 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
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TRAPPC8-202ENST00000577426 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 LYSMD2Q8IV50 215 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 SIAH3Q8IW03 269 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 PHC2Q8IXK0 858 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 CA13Q8N1Q1 262 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC8-202ENST00000577426 HORMAD2Q8N7B1 307 aa4.69□□□□□ -1.66
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