RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543184.5

PRAME-214, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-214ENST00000543184 RAB8AP61006 207 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 TBPL1P62380 186 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 RHAGQ02094 409 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 DCST1Q5T197 706 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 TRIM40Q6P9F5 258 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 UNC5DQ6UXZ4 953 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 RDH10Q8IZV5 341 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 OR5D16Q8NGK9 328 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 TMEM19Q96HH6 336 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 YIPF4Q9BSR8 244 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 KATNB1Q9BVA0 655 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 MND1Q9BWT6 205 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 TBC1D17Q9HA65 648 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 KCNK12Q9HB15 430 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 MCUBQ9NWR8 336 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 NDUFB11Q9NX14 153 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 IL20RAQ9UHF4 553 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 HSPB11Q9Y547 144 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 FRYLO94915 3013 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 SHISA3A0PJX4 238 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 GPR37L1O60883 481 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 B4GALT2O60909 372 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 LALBAP00709 142 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 ALPPL2P10696 532 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 PPIBP23284 216 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 HLA-FP30511 346 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 EVI2BP34910 448 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 AP1S2P56377 157 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 CTBP2P56545 445 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 FAPQ12884 760 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 HEPACAMQ14CZ8 416 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 MED27Q6P2C8 311 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 CNIH2Q6PI25 160 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 PLET1Q6UQ28 207 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 DEFB123Q8N688 67 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 ZNF480Q8WV37 535 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 TMEM159Q96B96 161 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 UPRTQ96BW1 309 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 TMED9Q9BVK6 235 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 EGLN3Q9H6Z9 239 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 PRDM6Q9NQX0 595 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 SEMA3GQ9NS98 782 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 MAT2BQ9NZL9 334 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 TEKT2Q9UIF3 430 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 ITM2BQ9Y287 266 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 C5orf58C9J3I9 102 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 NPIPB8E9PQR5 432 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 HRO43593 1189 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 SOCS5O75159 536 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 MOSPD3O75425 235 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 MPC1LP0DKB6 136 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 UQCRC1P31930 480 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 HMGA2P52926 109 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 FABP5Q01469 135 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 CNTN1Q12860 1018 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 ASAH1Q13510 395 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 IL18Q14116 193 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 GPR19Q15760 415 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 CRB2Q5IJ48 1285 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 TIGD4Q8IY51 512 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 SLC9A6Q92581 669 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 WACQ9BTA9 647 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 MIEF1Q9NQG6 463 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 TAAR2Q9P1P5 351 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 PRKAB1Q9Y478 270 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 GSAPA4D1B5 854 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 NPC1O15118 1278 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 CRYZL1O95825 349 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 ARAFP10398 606 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 IL12RB1P42701 662 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 GINS1Q14691 196 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 PGBD2Q6P3X8 592 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 Q8N402 240 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 OXR1Q8N573 874 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 MTERF3Q96E29 417 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 FAM83DQ9H4H8 585 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 SLA2Q9H6Q3 261 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 CLEC1BQ9P126 229 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 ANGPT4Q9Y264 503 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 PLOD3O60568 738 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 GSTM1P09488 218 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-214ENST00000543184 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms