RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533413.5

CKAP5-212, Transcript of cytoskeleton associated protein 5, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CKAP5, Length 3,084 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5-212ENST00000533413 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 ACOX1Q15067 660 aa5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 PYCR3Q53H96 274 aa5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 CCDC157Q569K6 752 aa5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 C6orf136Q5SQH8 315 aa5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 MTSS1LQ765P7 747 aa5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 ZNF438Q7Z4V0 828 aa5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 SYVN1Q86TM6 617 aa5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 P2RY8Q86VZ1 359 aa5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 ZFAND4Q86XD8 727 aa5.15□□□□□ -1.58
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CKAP5-212ENST00000533413 SNX29P2Q8IUI4 249 aa5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 LYSMD2Q8IV50 215 aa5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 ZZZ3Q8IYH5 903 aa5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 SVOPQ8N4V2 548 aa5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 CDYL2Q8N8U2 506 aa5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 OR4L1Q8NH43 312 aa5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 OR5K1Q8NHB7 308 aa5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 PSMA8Q8TAA3 256 aa5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 MCOLN3Q8TDD5 553 aa5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 CORO2AQ92828 525 aa5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 C5orf34Q96MH7 638 aa5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 ATOH8Q96SQ7 321 aa5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 ACOX2Q99424 681 aa5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 POFUT1Q9H488 388 aa5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 SLC52A3Q9NQ40 469 aa5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 ABCB8Q9NUT2 735 aa5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 TMEM45AQ9NWC5 275 aa5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 CD274Q9NZQ7 290 aa5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 PTGFRNQ9P2B2 879 aa5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 DTX4Q9Y2E6 619 aa5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 KCTD3Q9Y597 815 aa5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 PTPRDP23468 1912 aa5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 C2orf16Q68DN1 1984 aa5.15□□□□□ -1.58
CKAP5-212ENST00000533413 ASPDHA6ND91 283 aa5.15□□□□□ -1.59
CKAP5-212ENST00000533413 MROH6A6NGR9 719 aa5.15□□□□□ -1.59
CKAP5-212ENST00000533413 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
CKAP5-212ENST00000533413 E9PAM4 449 aa5.15□□□□□ -1.59
CKAP5-212ENST00000533413 UPK1AO00322 258 aa5.15□□□□□ -1.59
CKAP5-212ENST00000533413 BCKDKO14874 412 aa5.15□□□□□ -1.59
CKAP5-212ENST00000533413 MBTPS2O43462 519 aa5.15□□□□□ -1.59
CKAP5-212ENST00000533413 DFNA5O60443 496 aa5.15□□□□□ -1.59
CKAP5-212ENST00000533413 RPP40O75818 363 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
CKAP5-212ENST00000533413 UPK1BO75841 260 aa5.15□□□□□ -1.59
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CKAP5-212ENST00000533413 GATA4P43694 442 aa5.15□□□□□ -1.59
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CKAP5-212ENST00000533413 RNLSQ5VYX0 342 aa5.15□□□□□ -1.59
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CKAP5-212ENST00000533413 OVOS1Q6IE37 1185 aa5.15□□□□□ -1.59
CKAP5-212ENST00000533413 ZNF549Q6P9A3 640 aa5.15□□□□□ -1.59
CKAP5-212ENST00000533413 PAQR3Q6TCH7 311 aa5.15□□□□□ -1.59
CKAP5-212ENST00000533413 CYP20A1Q6UW02 462 aa5.15□□□□□ -1.59
CKAP5-212ENST00000533413 HDDC2Q7Z4H3 204 aa5.15□□□□□ -1.59
CKAP5-212ENST00000533413 HIPK1Q86Z02 1210 aa5.15□□□□□ -1.59
CKAP5-212ENST00000533413 SERPINA12Q8IW75 414 aa5.15□□□□□ -1.59
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CKAP5-212ENST00000533413 LGI2Q8N0V4 545 aa5.15□□□□□ -1.59
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CKAP5-212ENST00000533413 SETD6Q8TBK2 473 aa5.15□□□□□ -1.59
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CKAP5-212ENST00000533413 DERL2Q9GZP9 239 aa5.15□□□□□ -1.59
CKAP5-212ENST00000533413 S1PR5Q9H228 398 aa5.15□□□□□ -1.59
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CKAP5-212ENST00000533413 ABCC13Q9NSE7 274 aa5.15□□□□□ -1.59
CKAP5-212ENST00000533413 B3GNT2Q9NY97 397 aa5.15□□□□□ -1.59
CKAP5-212ENST00000533413 USE1Q9NZ43 259 aa5.15□□□□□ -1.59
CKAP5-212ENST00000533413 CLEC1BQ9P126 229 aa5.15□□□□□ -1.59
CKAP5-212ENST00000533413 ZNF221Q9UK13 617 aa5.15□□□□□ -1.59
CKAP5-212ENST00000533413 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa5.15□□□□□ -1.59
CKAP5-212ENST00000533413 ELOVL7A1L3X0 281 aa5.15□□□□□ -1.59
CKAP5-212ENST00000533413 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa5.15□□□□□ -1.59
CKAP5-212ENST00000533413 OR6C70A6NIJ9 312 aa5.15□□□□□ -1.59
CKAP5-212ENST00000533413 SLC22A31A6NKX4 558 aa5.15□□□□□ -1.59
CKAP5-212ENST00000533413 LRRTM2O43300 516 aa5.15□□□□□ -1.59
CKAP5-212ENST00000533413 OR4F21O95013 312 aa5.15□□□□□ -1.59
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