RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 MCUQ8NE86 351 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 ACMSDQ8TDX5 336 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 STMN2Q93045 179 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 MCUR1Q96AQ8 359 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 HAUS1Q96CS2 278 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 DTNBP1Q96EV8 351 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 OLFM3Q96PB7 478 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 FAM111AQ96PZ2 611 aa3.94□□□□□ -1.78
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SGCE-211ENST00000522045 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 CISHQ9NSE2 258 aa3.94□□□□□ -1.78
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SGCE-211ENST00000522045 PLLPQ9Y342 182 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 DOCK1Q14185 1865 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 SDR42E2A6NKP2 422 aa3.93□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 ENO4A6NNW6 628 aa3.93□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 COPEO14579 308 aa3.93□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 OGTO15294 1046 aa3.93□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 MED7O43513 233 aa3.93□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 SMIM24O75264 130 aa3.93□□□□□ -1.78
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SGCE-211ENST00000522045 DFFBO76075 338 aa3.93□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 TOMM70O94826 608 aa3.93□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 APOEP02649 317 aa3.93□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 BPGMP07738 259 aa3.93□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 LYNP07948 512 aa3.93□□□□□ -1.78
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SGCE-211ENST00000522045 CSH2P0DML3 217 aa3.93□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 KRT3P12035 628 aa3.93□□□□□ -1.78
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SGCE-211ENST00000522045 ELK3P41970 407 aa3.93□□□□□ -1.78
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SGCE-211ENST00000522045 NUMBP49757 651 aa3.93□□□□□ -1.78
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SGCE-211ENST00000522045 C6orf163Q5TEZ5 329 aa3.93□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 CES4AQ5XG92 561 aa3.93□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 JADE1Q6IE81 842 aa3.93□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa3.93□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 CRLF3Q8IUI8 442 aa3.93□□□□□ -1.78
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SGCE-211ENST00000522045 STKLD1Q8NE28 680 aa3.93□□□□□ -1.78
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SGCE-211ENST00000522045 PEBP4Q96S96 227 aa3.93□□□□□ -1.78
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SGCE-211ENST00000522045 VN1R1Q9GZP7 353 aa3.93□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 MIS12Q9H081 205 aa3.93□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 VCX3BQ9H321 246 aa3.93□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 PLK3Q9H4B4 646 aa3.93□□□□□ -1.78
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SGCE-211ENST00000522045 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 SPHK2Q9NRA0 654 aa3.93□□□□□ -1.78
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SGCE-211ENST00000522045 CYTH4Q9UIA0 394 aa3.93□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa3.93□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 IKBKGQ9Y6K9 419 aa3.93□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 LCTP09848 1927 aa3.93□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 RLFQ13129 1914 aa3.93□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 PHIPQ8WWQ0 1821 aa3.93□□□□□ -1.78
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