RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 PPP2CBP62714 309 aa6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 PPP2CAP67775 309 aa6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 RAD51Q06609 339 aa6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 C2orf54Q08AI8 447 aa6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
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PDCD4-211ENST00000498367 PEX6Q13608 980 aa6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 KEAP1Q14145 624 aa6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 CRMP1Q14194 572 aa6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 DPYSL3Q14195 570 aa6.81□□□□□ -1.32
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PDCD4-211ENST00000498367 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 CD300LGQ6UXG3 332 aa6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 CERS6Q6ZMG9 384 aa6.81□□□□□ -1.32
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PDCD4-211ENST00000498367 TSPAN33Q86UF1 283 aa6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 ADGRG3Q86Y34 549 aa6.81□□□□□ -1.32
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PDCD4-211ENST00000498367 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 LINC00116Q8NCU8 138 aa6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 OR5T2Q8NGG2 359 aa6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 MRAPQ8TCY5 172 aa6.81□□□□□ -1.32
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PDCD4-211ENST00000498367 SYT11Q9BT88 431 aa6.81□□□□□ -1.32
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PDCD4-211ENST00000498367 TPSD1Q9BZJ3 242 aa6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 WWTR1Q9GZV5 400 aa6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 HAPLN2Q9GZV7 340 aa6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 ELOVL3Q9HB03 270 aa6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 PLGRKTQ9HBL7 147 aa6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 VCX3AQ9NNX9 186 aa6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 SLC39A2Q9NP94 309 aa6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 GPR173Q9NS66 373 aa6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 TAS2R1Q9NYW7 299 aa6.81□□□□□ -1.32
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PDCD4-211ENST00000498367 SERTAD3Q9UJW9 196 aa6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 FAM96BQ9Y3D0 163 aa6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 RIPK3Q9Y572 518 aa6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 KPTNQ9Y664 436 aa6.81□□□□□ -1.32
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PDCD4-211ENST00000498367 A0A1W2PPQ1 181 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM89A2RUT3 159 aa6.8□□□□□ -1.32
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PDCD4-211ENST00000498367 H0YGN5 161 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 TEX46H3BTG2 121 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 M0QZK8 103 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 TRIM24O15164 1050 aa6.8□□□□□ -1.32
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PDCD4-211ENST00000498367 SLC28A2O43868 658 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 CBX6O95503 412 aa6.8□□□□□ -1.32
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PDCD4-211ENST00000498367 SBK3P0C264 359 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 NR2C1P13056 603 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
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PDCD4-211ENST00000498367 PPP2R1BP30154 601 aa6.8□□□□□ -1.32
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PDCD4-211ENST00000498367 DNA2P51530 1060 aa6.8□□□□□ -1.32
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PDCD4-211ENST00000498367 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.8□□□□□ -1.32
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PDCD4-211ENST00000498367 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
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PDCD4-211ENST00000498367 NPATQ14207 1427 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 P2RY14Q15391 338 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 MEP1AQ16819 746 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 LRRC36Q1X8D7 754 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 BSXQ3C1V8 233 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 MTX3Q5HYI7 312 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 AGAP6Q5VW22 663 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 ARMCX5Q6P1M9 558 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
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