RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	LUZP2	Q86TE4	346 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	LILRA2	Q8N149	483 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT78	Q8N1N4	520 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	ABHD4	Q8TB40	342 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	PERP	Q96FX8	193 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF597	Q96LX8	424 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	DGAT2	Q96PD7	388 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	AICDA	Q9GZX7	198 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	CNIH4	Q9P003	139 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	DAPP1	Q9UN19	280 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	LRIT2	A6NDA9	550 aa		9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM64B	A6NI03	449 aa		9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR47	O94967	919 aa		9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	FGG	P02679	453 aa		9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	MLN	P12872	115 aa		9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	GNAZ	P19086	355 aa		9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	PTMS	P20962	102 aa		9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	GCK	P35557	465 aa		9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	MASP1	P48740	699 aa		9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2L5	Q8NG80	312 aa		9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	NUBPL	Q8TB37	319 aa		9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	SMPDL3B	Q92485	455 aa		9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	DIO2	Q92813	273 aa		9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	ART5	Q96L15	291 aa		9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	SERPINB12	Q96P63	405 aa		9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	TIMP4	Q99727	224 aa		9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	CCL19	Q99731	98 aa		9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	COL6A5	A8TX70	2615 aa		9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	9.91	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	STAB1	Q9NY15	2570 aa		9.9	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		9.9	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	CD8B2	A6NJW9	211 aa		9.9	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF212B	A8MTL3	300 aa		9.9	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	CYR61	O00622	381 aa		9.9	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	CLGN	O14967	610 aa		9.9	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	ETHE1	O95571	254 aa		9.9	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	ACSL3	O95573	720 aa		9.9	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT14	P02533	472 aa		9.9	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	FPR1	P21462	350 aa		9.9	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	GSTM2	P28161	218 aa		9.9	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	CPOX	P36551	454 aa		9.9	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	9.9	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		9.9	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		9.9	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	9.9	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		9.9	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC15A4	Q8N697	577 aa		9.9	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		9.9	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		9.9	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF721	Q8TF20	911 aa		9.9	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	9.9	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	QRFPR	Q96P65	431 aa		9.9	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	PIP5K1A	Q99755	562 aa		9.9	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	9.9	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		9.9	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	GALNT8	Q9NY28	637 aa		9.9	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		9.9	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	RTTN	Q86VV8	2226 aa		9.9	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	MPDZ	O75970	2070 aa		9.89	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PPR1	153 aa		9.89	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	TP53I11	O14683	189 aa		9.89	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	IL18BP	O95998	194 aa		9.89	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	C1QA	P02745	245 aa		9.89	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP4B1	P13584	511 aa		9.89	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	CPN2	P22792	545 aa		9.89	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	MAGEA6	P43360	314 aa		9.89	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	GIPR	P48546	466 aa		9.89	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNC1	P48547	511 aa		9.89	□□□□□ -0.83

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