RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494395.1

ITGB1-217, Transcript of integrin subunit beta 1, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB1, Length 562 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1-217ENST00000494395 GSTM5P46439 218 aa8.13□□□□□ -1.11
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ITGB1-217ENST00000494395 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
ITGB1-217ENST00000494395 SORT1Q99523 831 aa8.12□□□□□ -1.11
ITGB1-217ENST00000494395 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
ITGB1-217ENST00000494395 FAIM2Q9BWQ8 316 aa8.12□□□□□ -1.11
ITGB1-217ENST00000494395 CENPHQ9H3R5 247 aa8.12□□□□□ -1.11
ITGB1-217ENST00000494395 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
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