RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	ARL8A	Q96BM9	186 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	HBEGF	Q99075	208 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	SH3GL2	Q99962	352 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	PSME2	Q9UL46	239 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	GTF3C1	Q12789	2109 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1W2PR48	441 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	ACOT7	O00154	380 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	TMPRSS11D	O60235	418 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	EED	O75530	441 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	SERPINB3	P29508	390 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	SOX3	P41225	446 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC1A6	P48664	564 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXA1	P55317	472 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	BTK	Q06187	659 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	MPP2	Q14168	576 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	15.98	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	RIT1	Q92963	219 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	TP53INP1	Q96A56	240 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	ACPT	Q9BZG2	426 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	CNIH4	Q9P003	139 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	MCM8	Q9UJA3	840 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	ITPR2	Q14571	2701 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	OR14I1	A6ND48	311 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	WWP2	O00308	870 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	SEC22B	O75396	215 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	WISP2	O76076	250 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	OR6B1	O95007	311 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHG3	P01860	377 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	GBA	P04062	536 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	CHRNG	P07510	517 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	PTGS2	P35354	604 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	HTR6	P50406	440 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC37A1	P57057	533 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	HMGCS1	Q01581	520 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	KANK2	Q63ZY3	851 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	C18orf63	Q68DL7	685 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2M7	Q8NG81	312 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1B0GVC2	190 aa		15.96	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	C1orf226	A1L170	272 aa		15.96	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	CAPN14	A8MX76	684 aa		15.96	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	PCDH7	O60245	1069 aa		15.96	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	SUSD5	O60279	629 aa		15.96	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	OR10H2	O60403	315 aa		15.96	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	AIFM1	O95831	613 aa		15.96	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424		P04436	131 aa		15.96	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	BGN	P21810	368 aa		15.96	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	PIK3R1	P27986	724 aa		15.96	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	PTGER4	P35408	488 aa		15.96	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	15.96	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	FUT7	Q11130	342 aa		15.96	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		15.96	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		15.96	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		15.96	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		15.96	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		15.96	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		15.96	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		15.96	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	TAGAP	Q8N103	731 aa		15.96	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		15.96	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		15.96	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		15.96	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	AGR3	Q8TD06	166 aa		15.96	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		15.96	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	15.96	■□□□□ 0.15

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