RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485729.1

HFE-212, Transcript of homeostatic iron regulator, humanhuman

TSL 3

Gene HFE, Length 777 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFE-212ENST00000485729 HMG20AQ9NP66 347 aa4.3□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 C12orf4Q9NQ89 552 aa4.3□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 PRSS16Q9NQE7 514 aa4.3□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 POLE3Q9NRF9 147 aa4.3□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 SNTG1Q9NSN8 517 aa4.3□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 ABCF3Q9NUQ8 709 aa4.3□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 KCND2Q9NZV8 630 aa4.3□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 EXTL2Q9UBQ6 330 aa4.3□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 HSPB7Q9UBY9 170 aa4.3□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 STOML2Q9UJZ1 356 aa4.3□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 SARDHQ9UL12 918 aa4.3□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa4.3□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa4.3□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 A0A087WXM4 84 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 A0A0B4J203 849 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 A0A1W2PPH5 198 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 A0A1W2PQM1 296 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 ANKUB1A6NFN9 424 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 TRIM64A6NGJ6 449 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 CBY3A6NI87 242 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 SAGE2PA6NJ88 616 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 D6RAR5 112 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 KLF11O14901 512 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 MDM4O15151 490 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 SLC22A2O15244 555 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 MID1O15344 667 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 LATO43561 262 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 GATCO43716 136 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 SPAG7O75391 227 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 TM7SF2O76062 418 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 IFNA2P01563 188 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 ABHD2P08910 425 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 FAM58BPP0C7Q3 252 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 ANPEPP15144 967 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 ITGAXP20702 1163 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 F8A1P23610 371 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 FMO4P31512 558 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 HOXD13P35453 343 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 GP5P40197 560 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 ETV5P41161 510 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 TMBIM6P55061 237 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 AP1S2P56377 157 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 PEX3P56589 373 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 FOLH1Q04609 750 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 TMEM132DQ14C87 1099 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 PDK3Q15120 406 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 CYTH1Q15438 398 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 CST6Q15828 149 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 KYNUQ16719 465 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 TSTQ16762 297 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 DEFB133Q30KQ1 61 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 NADK2Q4G0N4 442 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 VWA2Q5GFL6 755 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 FAM76BQ5HYJ3 339 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 JADE1Q6IE81 842 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 SULT1C3Q6IMI6 304 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 C11orf87Q6NUJ2 197 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 FAM180BQ6P0A1 224 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 PEX26Q7Z412 305 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 LRRC6Q86X45 466 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 NKAIN4Q8IVV8 208 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 UNC45BQ8IWX7 931 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 TMEM86AQ8N2M4 240 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 NRACQ8N912 160 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 EXD1Q8NHP7 514 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 FBXO32Q969P5 355 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 WBP2Q969T9 261 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 NCLNQ969V3 563 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 EGLN2Q96KS0 407 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 ZNF560Q96MR9 790 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 VPS35Q96QK1 796 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 RANBP9Q96S59 729 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 COQ7Q99807 217 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 ERP44Q9BS26 406 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 TMEM79Q9BSE2 394 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 CCSER1Q9C0I3 900 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 DPEP3Q9H4B8 488 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 POLD4Q9HCU8 107 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 CHST11Q9NPF2 352 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 DECR2Q9NUI1 292 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 ELOVL5Q9NYP7 299 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 CLIC5Q9NZA1 410 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 VPS54Q9P1Q0 977 aa4.29□□□□□ -1.72
HFE-212ENST00000485729 COPG2Q9UBF2 871 aa4.29□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms