RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC25A36Q96CQ1 311 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 TXN2Q99757 166 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 WDR76Q9H967 626 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 COG4Q9H9E3 785 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 NDE1Q9NXR1 346 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 WWOXQ9NZC7 414 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 ATP6V1HQ9UI12 483 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 IKZF3Q9UKT9 509 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 AFF2P51816 1311 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 NR5A2O00482 541 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 MFN2O95140 757 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 CD1DP15813 335 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC1A6P48664 564 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 PPIAP62937 165 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 NFATC2Q13469 925 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 SULT1C3Q6IMI6 304 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 ERASQ7Z444 233 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 P4HA3Q7Z4N8 544 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 CUZD1Q86UP6 607 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNMB4Q86W47 210 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 CARM1Q86X55 608 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 METTL4Q8N3J2 472 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 STKLD1Q8NE28 680 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 OR10T2Q8NGX3 314 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 OR4F5Q8NH21 305 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 OR2T6Q8NHC8 308 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 ANKRD27Q96NW4 1050 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 TSPAN18Q96SJ8 248 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 CPXM1Q96SM3 734 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 LGMNQ99538 433 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 CRACR2AQ9BSW2 395 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 Q9HAA7 133 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 IL1RAPQ9NPH3 570 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 CHMP2BQ9UQN3 213 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A0A6YYD4 124 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 TRIM49BA6NDI0 452 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 H3BTX0 84 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 E2F3O00716 465 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 CYB561D2O14569 222 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 TFECO14948 347 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF749O43361 778 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 EDIL3O43854 480 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM200BP0CF97 657 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 ADORA3P0DMS8 318 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 EPB41P11171 864 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 HTR2AP28223 471 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 AXLP30530 894 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 PTGFRP43088 359 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 IFNAR2P48551 515 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 NAPAP54920 295 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM50BP56557 158 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 MOGAT2Q3SYC2 334 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 NIPAL3Q6P499 406 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC39A4Q6P5W5 647 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 ZFAND4Q86XD8 727 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF614Q8N883 585 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 BANPQ8N9N5 519 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 C11orf45Q8TAV5 145 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 FBXO30Q8TB52 745 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 RCHY1Q96PM5 261 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 VPS35Q96QK1 796 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 C19orf43Q9BQ61 176 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 TEX13BQ9BXU2 312 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 LRRCC1Q9C099 1032 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 PARLQ9H300 379 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 WDR41Q9HAD4 459 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 GDAP2Q9NXN4 497 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 BARHL2Q9NY43 387 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 TBK1Q9UHD2 729 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 FZR1Q9UM11 496 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 DUSP12Q9UNI6 340 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 GAB2Q9UQC2 676 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 FKBP7Q9Y680 259 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 CUX2O14529 1486 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 ALOX15BO15296 676 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 OR4F21O95013 312 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 IGHDP01880 384 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 ASNSP08243 561 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC35G4P0C7Q5 338 aa3.87□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.4 ms