RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	DHFR2	Q86XF0	187 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	MICU2	Q8IYU8	434 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	JADE3	Q92613	823 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	GIMAP5	Q96F15	307 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	WASF3	Q9UPY6	502 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A1W2PS29	197 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	DUXA	A6NLW8	204 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529		H0YHG0	523 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	DLGAP3	O95886	979 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	AGR2	O95994	175 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	GUSB	P08236	651 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	UMPS	P11172	480 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	MAN2A2	P49641	1150 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	OR4D2	P58180	307 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	ERV3-1	Q14264	604 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	MYBPC3	Q14896	1274 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	NKG7	Q16617	165 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	VMAC	Q2NL98	169 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	VWA2	Q5GFL6	755 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	C1orf189	Q5VU69	101 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	AAGAB	Q6PD74	315 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	PTOV1	Q86YD1	416 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	C10orf111	Q8N326	155 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	RNF148	Q8N7C7	305 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	OR7G2	Q8NG99	324 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	PMM1	Q92871	262 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	RIT1	Q92963	219 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	NACC2	Q96BF6	587 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	ACACB	O00763	2458 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	OR10H2	O60403	315 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	FKBP6	O75344	327 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	JRK	O75564	520 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	STAMBP	O95630	424 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	TFPT	P0C1Z6	253 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	JMJD7	P0C870	316 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	ARAF	P10398	606 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF28	P17035	718 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	PCGF2	P35227	344 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	MC3R	P41968	323 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	RHD	Q02161	417 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	FLOT2	Q14254	428 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	GLYAT	Q6IB77	296 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM205	Q6UW68	189 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	CCDC80	Q76M96	950 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	RNF130	Q86XS8	419 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	LGI4	Q8N135	537 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	EID3	Q8N140	333 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	NUP43	Q8NFH3	380 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	DGAT2	Q96PD7	388 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	SPSB2	Q99619	263 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	TRIM15	Q9C019	465 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5

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