RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466037.6

HOXB-AS3-204, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 522 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-204ENST00000466037 STSP08842 583 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DDCP20711 480 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TMED10P49755 219 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C2orf80Q0P641 193 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MAP4K2Q12851 820 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SH2D4BQ5SQS7 431 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C1QL3Q5VWW1 255 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KANK2Q63ZY3 851 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NOXRED1Q6NXP6 359 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM180BQ6P0A1 224 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NUDCD3Q8IVD9 361 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CLYBLQ8N0X4 340 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GHDCQ8N2G8 530 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ADCY4Q8NFM4 1077 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TP53INP1Q96A56 240 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM173AQ9BQD7 235 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRAF6Q9Y4K3 522 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 G3V3Y1 287 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC19A2O60779 497 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CLPSP04118 112 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CNR1P21554 472 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MPIP34949 423 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC22A10Q63ZE4 541 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LRIG3Q6UXM1 1119 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IKBIPQ70UQ0 350 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FJX1Q86VR8 437 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SIAH3Q8IW03 269 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCDC116Q8IYX3 515 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF615Q8N8J6 731 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OR2M7Q8NG81 312 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AGR3Q8TD06 166 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF681Q96N22 645 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KCNK9Q9NPC2 374 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MYNNQ9NPC7 610 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MAT2BQ9NZL9 334 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PRODH2Q9UF12 536 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TP53I11O14683 189 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TM9SF1O15321 606 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP18.25■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FGF4P08620 206 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FBXO45P0C2W1 286 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LINC00032P0C843 101 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ABOP16442 354 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PRPH2P23942 346 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NTSP30990 170 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PTGER1P34995 402 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SERPINB4P48594 390 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PPIAP62937 165 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RNFT1Q5M7Z0 435 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM111BQ6SJ93 734 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RGS9BPQ6ZS82 235 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RNF165Q6ZSG1 346 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC22A16Q86VW1 577 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C17orf47Q8NEP4 570 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OR5M3Q8NGP4 307 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C16orf52Q8NHV5 167 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TWIST2Q8WVJ9 160 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZBTB9Q96C00 473 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZGRF1Q86YA3 2104 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HS6ST1O60243 411 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZWINTO95229 277 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NADKO95544 446 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LDLRP01130 860 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCL3P10147 92 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PCSK2P16519 638 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RPL38P63173 70 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KCNJ2P63252 427 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RPP38P78345 283 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LTB4RQ15722 352 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GALNTL6Q49A17 601 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM71E1Q6IPT2 247 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PAOXQ6QHF9 649 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EXOC3L1Q86VI1 746 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TICAM1Q8IUC6 712 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM9CQ8IZT9 166 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OR52R1Q8NGF1 315 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OR9A2Q8NGT5 310 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF675Q8TD23 568 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ERP27Q96DN0 273 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PGM2Q96G03 612 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms