RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 CERS4Q9HA82 394 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 SLC6A20Q9NP91 592 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 NGBQ9NPG2 151 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ACOT9Q9Y305 439 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 FAM96BQ9Y3D0 163 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 NID2Q14112 1375 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 A0A0G2JN53 185 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 SERTM1A2A2V5 107 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 SPDYE2BA6NHP3 402 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 F5H5P2 479 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 CTDNEP1O95476 244 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 MT-ND5P03915 603 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 SPDYE6P0CI01 402 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 BCKDHAP12694 445 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 PTPN7P35236 360 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 VAMP7P51809 220 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 HUNKP57058 714 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 FPGSQ05932 587 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 CSHL1Q14406 222 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 C4orf17Q53FE4 359 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 MANEALQ5VSG8 457 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 GLT8D1Q68CQ7 371 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 CHRDL2Q6WN34 429 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 CYHR1Q6ZMK1 362 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF367Q7RTV3 350 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 CBLN2Q8IUK8 224 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 STPG2Q8N412 459 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF610Q8N9Z0 462 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 POGLUT1Q8NBL1 392 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 NFKBIDQ8NI38 313 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 HMCESQ96FZ2 354 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 MICU1Q9BPX6 476 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 MACROD1Q9BQ69 325 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 SGIP1Q9BQI5 828 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 SH2D3AQ9BRG2 576 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 RSRP1Q9BUV0 290 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 LMAN1LQ9HAT1 526 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 KIAA1024Q9UPX6 916 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 SCML2Q9UQR0 700 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ZFYVE9O95405 1425 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 FANCAO15360 1455 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 USP17L5A8MUK1 530 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 USP17L15C9J2P7 530 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 USP17L10C9JJH3 530 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 USP17L12C9JPN9 530 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 USP17L11C9JVI0 530 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 USP17L21D6R901 530 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 USP17L18D6R9N7 530 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 USP17L22D6RA61 530 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 USP17L19D6RCP7 530 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 USP17L20D6RJB6 530 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 SIGLEC5O15389 551 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM63AO94886 807 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 PDE8BO95263 885 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 OR2C1O95371 312 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 HPRP00739 348 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 DPEP1P16444 411 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 MC5RP33032 325 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 JAK3P52333 1124 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 DLX5P56178 289 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 USP17L24Q0WX57 530 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 SEZ6Q53EL9 994 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ADNP2Q6IQ32 1131 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 AADACL2Q6P093 401 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 VASH2Q86V25 355 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 SERINC5Q86VE9 423 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 SERPINA9Q86WD7 417 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM151AQ8N4L1 468 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 KLHDC1Q8N7A1 406 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 SYT14Q8NB59 555 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 Q8NFD4 153 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 OR5M9Q8NGP3 310 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 UBTD2Q8WUN7 234 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 TOMM40LQ969M1 308 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 OR4K3Q96R72 315 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 C2orf88Q9BSF0 95 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ERVW-1Q9UQF0 538 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ANKARQ7Z5J8 1434 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 A0A0J9YYE9 177 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1W2PPH5 198 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 B4DXG7 233 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa5.35□□□□□ -1.55
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