RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 AKTIPQ9H8T0 292 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 MEAF6Q9HAF1 191 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 ASIC5Q9NY37 505 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 SH3BP4Q9P0V3 963 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 LRFN1Q9P244 771 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 PRODH2Q9UF12 536 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 BCAP29Q9UHQ4 241 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 A8MVJ9 347 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 MYO1GB0I1T2 1018 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 WWP2O00308 870 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 AKAP10O43572 662 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 MAN1A2O60476 641 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 OR2J2O76002 312 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 F10P00742 488 aa14.27□□□□□ -0.13
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PGGT1B-202ENST00000379615 LBPP18428 481 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 SSTR4P31391 388 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 PIGGQ5H8A4 983 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF766Q5HY98 468 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 TAGAPQ8N103 731 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ADCY4Q8NFM4 1077 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 DOK4Q8TEW6 326 aa14.27□□□□□ -0.13
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PGGT1B-202ENST00000379615 TP53INP1Q96A56 240 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 CTHRC1Q96CG8 243 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP1R36Q96LQ0 422 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 C7orf26Q96N11 449 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 GAL3ST4Q96RP7 486 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 C1orf50Q9BV19 199 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 EPN3Q9H201 632 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 CLMPQ9H6B4 373 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 MED4Q9NPJ6 270 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ATAD3AQ9NVI7 634 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 HPF1Q9NWY4 346 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ANKRD10Q9NXR5 420 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 MAT2BQ9NZL9 334 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 LUZP4Q9P127 313 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 GIMAP2Q9UG22 337 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ERVK-11Q9UQG0 969 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 CSAG2Q9Y5P2 127 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 HRKO00198 91 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 PDPK1O15530 556 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 PLOD3O60568 738 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 LRATO95237 230 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 JUNP05412 331 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 TLE1Q04724 770 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 MGAT2Q10469 447 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC25A25Q6KCM7 469 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM180BQ6P0A1 224 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM111BQ6SJ93 734 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 C9orf40Q8IXQ3 194 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF615Q8N8J6 731 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 Q8NA96 180 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 MDS2Q8NDY4 140 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 C17orf47Q8NEP4 570 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 OR9A2Q8NGT5 310 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 CLHC1Q8NHS4 586 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 SGCZQ96LD1 299 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 RASL10BQ96S79 203 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 WWTR1Q9GZV5 400 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 MAP10Q9P2G4 905 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ATP6V1HQ9UI12 483 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF639Q9UID6 485 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM200CA6NKL6 621 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 CAPN14A8MX76 684 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC25A12O75746 678 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 WISP1O95388 367 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 SP1P08047 785 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 IFI6P09912 130 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 CT62P0C5K7 136 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 G6PDP11413 515 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 S1PR1P21453 382 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 CLDN8P56748 225 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 NRG3P56975 720 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 DCAF7P61962 342 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 PSPHP78330 225 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 KCNC4Q03721 635 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 PDE7AQ13946 482 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 EBPQ15125 230 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 LTB4RQ15722 352 aa14.25□□□□□ -0.13
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