RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363519.1

RNU6-509P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 509, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-509P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-509P-201ENST00000363519 DUX4L5P0CJ88 424 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 DUX4L6P0CJ89 424 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 DUX4L7P0CJ90 424 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 NR2F1P10589 423 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 HSD17B1P14061 328 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 ADRA2CP18825 462 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 EPORP19235 508 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 ACP1P24666 158 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 CCNCP24863 283 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 ACKR3P25106 362 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 UCP1P25874 307 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 PSMB4P28070 264 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 CD1BP29016 333 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 PPP2R1BP30154 601 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 GCH1P30793 250 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 SSTR1P30872 391 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 ARL3P36405 182 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 TRIM23P36406 574 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 HSD17B3P37058 310 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 PTGDSP41222 190 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 OR3A3P47888 321 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 RGS7P49802 495 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 STAT2P52630 851 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 NAGLUP54802 743 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 MFAP3P55082 362 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 ZNF85Q03923 595 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 RBPJQ06330 500 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 SULT2A1Q06520 285 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 IL10RBQ08334 325 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 CCDC57Q2TAC2 916 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 OR2B11Q5JQS5 317 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 DCAF12Q5T6F0 453 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 RAET1LQ5VY80 246 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 CAMKMTQ7Z624 323 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 NRARPQ7Z6K4 114 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 GVQW1Q8N7I0 195 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 Q8N9W7 124 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 SLC4A11Q8NBS3 891 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 OR13C5Q8NGS8 318 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 OR52P1PQ8NH57 321 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 UBALD1Q8TB05 177 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 FNDC8Q8TC99 324 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 FRZBQ92765 325 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 TRIM63Q969Q1 353 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 PTERQ96BW5 349 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 BIRC7Q96CA5 298 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 HAVCR1Q96D42 359 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 PCED1BQ96HM7 432 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 C9orf85Q96MD7 179 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 FOPNLQ96NB1 174 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 SCLT1Q96NL6 688 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 PSMD1Q99460 953 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 HCAR1Q9BXC0 346 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 PCGF6Q9BYE7 350 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 ELOVL4Q9GZR5 314 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 DPEP2Q9H4A9 486 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 ZNF665Q9H7R5 613 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 Q9HAA7 133 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 S100A14Q9HCY8 104 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 PDE7BQ9NP56 450 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 DNAJC11Q9NVH1 559 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 DUX4Q9UBX2 424 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 LCMT1Q9UIC8 334 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 GGA2Q9UJY4 613 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 ZNF225Q9UK10 706 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 SDK1Q7Z5N4 2213 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 STRCP1A6NGW2 1772 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 PLA2R1Q13018 1463 aa-0.1□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 FGD5Q6ZNL6 1462 aa-0.1□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa-0.1□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa-0.1□□□□□ -2.42
RNU6-509P-201ENST00000363519 KIAA1671Q9BY89 1806 aa-0.1□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms