RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 RNF175Q8N4F7 328 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-201ENST00000345716 TPSD1Q9BZJ3 242 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-201ENST00000345716 GORASP2Q9H8Y8 452 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-201ENST00000345716 MBD2Q9UBB5 411 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-201ENST00000345716 C1orf105O95561 183 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-201ENST00000345716 CBX5P45973 191 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-201ENST00000345716 CAMK1Q14012 370 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-201ENST00000345716 OR9Q2Q8NGE9 314 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-201ENST00000345716 NEIL3Q8TAT5 605 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-201ENST00000345716 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-201ENST00000345716 ACTRT3Q9BYD9 372 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-201ENST00000345716 RIMS3Q9UJD0 308 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-201ENST00000345716 CDH10Q9Y6N8 788 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-201ENST00000345716 OR2B3O76000 313 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-201ENST00000345716 RABIFP47224 123 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-201ENST00000345716 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
NISCH-201ENST00000345716 OR6N2Q8NGY6 317 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-201ENST00000345716 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-201ENST00000345716 GTF2H4Q92759 462 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-201ENST00000345716 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
NISCH-201ENST00000345716 ZNF597Q96LX8 424 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-201ENST00000345716 HS6ST2Q96MM7 605 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-201ENST00000345716 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
NISCH-201ENST00000345716 HMX2A2RU54 273 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-201ENST00000345716 SOX30O94993 753 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-201ENST00000345716 PEPDP12955 493 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-201ENST00000345716 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
NISCH-201ENST00000345716 MICAQ29983 383 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-201ENST00000345716 PEX11GQ96HA9 241 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-201ENST00000345716 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
NISCH-201ENST00000345716 ERVFC1P60507 584 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 PGM2L1Q6PCE3 622 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 RNF111Q6ZNA4 994 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 CCL26Q9Y258 94 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 LSAMPQ13449 338 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 INAVAQ3KP66 663 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 RFLNAQ6ZTI6 216 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 RETREG3Q86VR2 466 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 NSMAFQ92636 917 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 ISL2Q96A47 359 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 CA14Q9ULX7 337 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 LTBP4Q8N2S1 1624 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 STRCP1A6NGW2 1772 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 A0A1W2PRG6 482 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 C11orf98E9PRG8 122 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 FLRT2O43155 660 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 KIAA0513O60268 411 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 PPM1BO75688 479 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 GABBR2O75899 941 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 TFPTP0C1Z6 253 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 ITIH1P19827 911 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 RPL34P49207 117 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 GPR143P51810 404 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 TFAP2CQ92754 450 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 TMIGD2Q96BF3 282 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 BIRC8Q96P09 236 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 DPAGT1Q9H3H5 408 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 MYNNQ9NPC7 610 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 CYB5AP00167 134 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 S100A1P23297 94 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 CASRP41180 1078 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 ARHGAP19Q14CB8 494 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 DEFB110Q30KQ9 67 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 PRSS48Q7RTY5 328 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 C15orf40Q8WUR7 153 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 TESCQ96BS2 214 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 DUX1O43812 170 aa19.69■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 SCO2O43819 266 aa19.69■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa19.69■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 RBP7Q96R05 134 aa19.69■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 LHPPQ9H008 270 aa19.69■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 AASSQ9UDR5 926 aa19.69■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 NME7Q9Y5B8 376 aa19.69■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 SOBPA7XYQ1 873 aa19.69■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 OSMP13725 252 aa19.69■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 FBLP22087 321 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 UGT2A3Q6UWM9 527 aa19.69■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 USP53Q70EK8 1073 aa19.69■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 HHIPL1Q96JK4 782 aa19.69■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 FAM210AQ96ND0 272 aa19.69■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 M0R3H8 397 aa19.69■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 ABLIM3O94929 683 aa19.69■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 OR3A3P47888 321 aa19.69■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 OR3A2P47893 321 aa19.69■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 CLDN2P57739 230 aa19.69■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 PLCXD2Q0VAA5 305 aa19.69■□□□□ 0.74
NISCH-201ENST00000345716 ARFRP1Q13795 201 aa19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.9 ms