RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A087WV62 115 aa25.64■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAD1O60671 282 aa25.64■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 IFI6P09912 130 aa25.64■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAB40ALP0C0E4 278 aa25.64■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 PGDP52209 483 aa25.64■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR4D2P58180 307 aa25.64■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPS15P62841 145 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAP4K2Q12851 820 aa25.64■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPATS1Q496A3 300 aa25.64■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 SAXO2Q658L1 398 aa25.64■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM111BQ6SJ93 734 aa25.64■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM151BQ8IW70 566 aa25.64■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 ULK2Q8IYT8 1036 aa25.64■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF148Q8N7C7 305 aa25.64■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR7G2Q8NG99 324 aa25.64■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 CT55Q8WUE5 264 aa25.64■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 NRSN2Q9GZP1 204 aa25.64■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 IKZF5Q9H5V7 419 aa25.64■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 PACSIN3Q9UKS6 424 aa25.64■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 GMEB1Q9Y692 573 aa25.64■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 A8MUA0 341 aa25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 C17orf105B2RV13 164 aa25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLOD3O60568 738 aa25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDE5AO76074 875 aa25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 FOLR3P41439 243 aa25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 CRATP43155 626 aa25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 FOXL2P58012 376 aa25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 LIPEQ05469 1076 aa25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIGGQ5H8A4 983 aa25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 IFNEQ86WN2 208 aa25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR52N2Q8NGI0 321 aa25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR10A6Q8NH74 314 aa25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 DOK4Q8TEW6 326 aa25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC35G5Q96KT7 338 aa25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 CNPPD1Q9BV87 410 aa25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 ALG2Q9H553 416 aa25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 NUP210LQ5VU65 1888 aa25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 BRINP1O60477 761 aa25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPX2P18283 190 aa25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 ME2P23368 584 aa25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 RGNQ15493 299 aa25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 CYP51A1Q16850 503 aa25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP25.63■■□□□ 1.693e-7■■■■■ 62.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGF2-ASQ6U949 168 aa25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF130Q86XS8 419 aa25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2L13Q8N349 312 aa25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIF1Q9H611 641 aa25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 EPS8L2Q9H6S3 715 aa25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 AK5Q9Y6K8 562 aa25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDRT15L2A8MXV6 281 aa25.62■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 UPK1AO00322 258 aa25.62■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 CIB2O75838 187 aa25.62■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 CT62P0C5K7 136 aa25.62■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 FADDQ13158 208 aa25.62■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 CEACAM7Q14002 265 aa25.62■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANKRD37Q7Z713 158 aa25.62■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2Y1Q8NGV0 311 aa25.62■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR14A16Q8NHC5 309 aa25.62■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 CTHRC1Q96CG8 243 aa25.62■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM122AQ96E09 287 aa25.62■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 MS4A4EQ96PG1 132 aa25.62■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 THSD1Q9NS62 852 aa25.62■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 NTMQ9P121 344 aa25.62■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 BCAP29Q9UHQ4 241 aa25.62■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRORSD1PA6NEY8 169 aa25.61■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 COQ9O75208 318 aa25.61■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 EFNA3P52797 238 aa25.61■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 MGAT2Q10469 447 aa25.61■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 FOXC1Q12948 553 aa25.61■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 LANCL3Q6ZV70 420 aa25.61■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 HPS6Q86YV9 775 aa25.61■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 TNIP2Q8NFZ5 429 aa25.61■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 ART5Q96L15 291 aa25.61■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANKRA2Q9H9E1 313 aa25.61■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 EQTNQ9NQ60 294 aa25.61■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 C21orf140B9A014 251 aa25.6■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGHEP01854 428 aa25.6■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 HSD17B1P14061 328 aa25.6■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 STAT5AP42229 794 aa25.6■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 GSK3BP49841 420 aa25.6■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 CASP9P55211 416 aa25.6■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP25.6■■□□□ 1.696e-18■■□□□ 12.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms