RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222305.7

USF2-201, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USF2, Length 1,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2-201ENST00000222305 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 PIF1Q9H611 641 aa21.48■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 EPS8L2Q9H6S3 715 aa21.48■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 SPTBN4Q9H254 2564 aa21.48■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 EVPLLA8MZ36 301 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 HRKO00198 91 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 UPK1AO00322 258 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 PLOD2O00469 737 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 EMC8O43402 210 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 ALOX12BO75342 701 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 TNNI3P19429 210 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 PGDP52209 483 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 BIKQ13323 160 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 CEACAM7Q14002 265 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 MAP7Q14244 749 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 SAXO2Q658L1 398 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 C6orf120Q7Z4R8 191 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 SFXN5Q8TD22 340 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 C3orf14Q9HBI5 128 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 GPATCH2Q9NW75 528 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 KLK13Q9UKR3 277 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 PRORSD1PA6NEY8 169 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 C17orf105B2RV13 164 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 NME6O75414 186 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 RPS18P62269 152 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 RPS26P62854 115 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 PIGGQ5H8A4 983 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 COX20Q5RI15 118 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.035e-10■■□□□ 14.3
USF2-201ENST00000222305 FHL5Q5TD97 284 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 C6orf163Q5TEZ5 329 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 ANKRD37Q7Z713 158 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 RNF130Q86XS8 419 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 ULK2Q8IYT8 1036 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 VWA5B2Q8N398 1253 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 FAM156AQ8NDB6 213 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 NUP43Q8NFH3 380 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 OR10A6Q8NH74 314 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 CTHRC1Q96CG8 243 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 NEURL3Q96EH8 262 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 SH3GL1Q99961 368 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 NRSN2Q9GZP1 204 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 ADAP2Q9NPF8 381 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 USP22Q9UPT9 525 aa21.47■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa21.46■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 UMODP07911 640 aa21.46■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 STAT5AP42229 794 aa21.46■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 ID4P47928 161 aa21.46■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 MVDP53602 400 aa21.46■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 PRR5P85299 388 aa21.46■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 MAP4K2Q12851 820 aa21.46■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 IGF2-ASQ6U949 168 aa21.46■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 IFNEQ86WN2 208 aa21.46■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 OR2L13Q8N349 312 aa21.46■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 OR2Y1Q8NGV0 311 aa21.46■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 METTL21AQ8WXB1 218 aa21.46■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 ECSITQ9BQ95 431 aa21.46■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 CNPPD1Q9BV87 410 aa21.46■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 EQTNQ9NQ60 294 aa21.46■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 PTGFRNQ9P2B2 879 aa21.46■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 ERVK-19Q9WJR5 959 aa21.46■■□□□ 1.03
USF2-201ENST00000222305 BRINP1O60477 761 aa21.45■■□□□ 1.02
USF2-201ENST00000222305 SLITRK5O94991 958 aa21.45■■□□□ 1.02
USF2-201ENST00000222305 KRT75O95678 551 aa21.45■■□□□ 1.02
USF2-201ENST00000222305 NQO1P15559 274 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
USF2-201ENST00000222305 PPIBP23284 216 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
USF2-201ENST00000222305 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
USF2-201ENST00000222305 OR4D2P58180 307 aa21.45■■□□□ 1.02
USF2-201ENST00000222305 LIPEQ05469 1076 aa21.45■■□□□ 1.02
USF2-201ENST00000222305 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
USF2-201ENST00000222305 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
USF2-201ENST00000222305 HPS6Q86YV9 775 aa21.45■■□□□ 1.02
USF2-201ENST00000222305 OR56A1Q8NGH5 318 aa21.45■■□□□ 1.02
USF2-201ENST00000222305 MOAP1Q96BY2 351 aa21.45■■□□□ 1.02
USF2-201ENST00000222305 SLC35G5Q96KT7 338 aa21.45■■□□□ 1.02
USF2-201ENST00000222305 ALG2Q9H553 416 aa21.45■■□□□ 1.02
USF2-201ENST00000222305 GMEB1Q9Y692 573 aa21.45■■□□□ 1.02
USF2-201ENST00000222305 AK5Q9Y6K8 562 aa21.45■■□□□ 1.02
USF2-201ENST00000222305 A0A087WV62 115 aa21.44■■□□□ 1.02
USF2-201ENST00000222305 PLOD3O60568 738 aa21.44■■□□□ 1.02
USF2-201ENST00000222305 CBX7O95931 251 aa21.44■■□□□ 1.02
USF2-201ENST00000222305 RAB40ALP0C0E4 278 aa21.44■■□□□ 1.02
USF2-201ENST00000222305 GPX2P18283 190 aa21.44■■□□□ 1.02
USF2-201ENST00000222305 S1PR1P21453 382 aa21.44■■□□□ 1.02
USF2-201ENST00000222305 CD82P27701 267 aa21.44■■□□□ 1.02
USF2-201ENST00000222305 SSTR4P31391 388 aa21.44■■□□□ 1.02
USF2-201ENST00000222305 GALNSP34059 522 aa21.44■■□□□ 1.02
USF2-201ENST00000222305 SOX11P35716 441 aa21.44■■□□□ 1.02
USF2-201ENST00000222305 DLSTP36957 453 aa21.44■■□□□ 1.02
USF2-201ENST00000222305 FOLR3P41439 243 aa21.44■■□□□ 1.02
USF2-201ENST00000222305 CRATP43155 626 aa21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.6 ms