RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000075430.11

CTDP1-201, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 3,538 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-201ENST00000075430 IZUMO1Q8IYV9 350 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 ACOXLQ9NUZ1 547 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 ASIC5Q9NY37 505 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 FTSJ1Q9UET6 329 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 NTNG1Q9Y2I2 539 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 SCN3AQ9NY46 2000 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 INPPL1O15357 1258 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 LALBAP00709 142 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 RHCEP18577 417 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 IMPA1P29218 277 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 ERP29P30040 261 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 HNMTP50135 292 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF81P51508 661 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 MVDP53602 400 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 REEP3Q6NUK4 255 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 XKRXQ6PP77 449 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 OR4M1Q8NGD0 313 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 WDR20Q8TBZ3 569 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 RNF208Q9H0X6 261 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 ABCG5Q9H222 651 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 C3orf14Q9HBI5 128 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 MAPRE3Q9UPY8 281 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 A3GALT2U3KPV4 340 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 HYKKA2RU49 373 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 SEMA7AO75326 666 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 C1SP09871 688 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 PPIBP23284 216 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 GZMKP49863 264 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF750Q32MQ0 723 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 SLC25A46Q96AG3 418 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 GULP1Q9UBP9 304 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 BTNL2Q9UIR0 455 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 A0A075B6Q4 140 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 ETV6P41212 452 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 MAB21L1Q13394 359 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP15.87■□□□□ 0.134e-6■■■■□ 20.6
CTDP1-201ENST00000075430 RNF170Q96K19 258 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 GPA33Q99795 319 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 SATB2Q9UPW6 733 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 CORO2BQ9UQ03 480 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 LANCL1O43813 399 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 LRG1P02750 347 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 CD3GP09693 182 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 NAT1P18440 290 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 SPINT3P49223 89 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 FCRLBQ6BAA4 426 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 SAMD12Q8N8I0 201 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 OR51G2Q8NGK0 314 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 OR8J1Q8NGP2 316 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 UBTD2Q8WUN7 234 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 COL26A1Q96A83 441 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 PLD4Q96BZ4 506 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 C12orf66Q96MD2 445 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 RAD9AQ99638 391 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 OR2AG1Q9H205 316 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 A0A0B4J203 849 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 POM121CA8CG34 1229 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 ACRP10323 421 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 COX10Q12887 443 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF480Q8WV37 535 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 UFD1Q92890 307 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 SCRN2Q96FV2 425 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 MED20Q9H944 212 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 SLC13A4Q9UKG4 626 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 HCN2Q9UL51 889 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 ASF1AQ9Y294 204 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 CCL16O15467 120 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 HOXA2O43364 376 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 ORC5O43913 435 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 SLC2A10O95528 541 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 NNMTP40261 264 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 GPR4P46093 362 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 ABATP80404 500 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 ARSIQ5FYB1 569 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 LIPJQ5W064 366 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 ARL9Q6T311 187 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 OXR1Q8N573 874 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 LRRC17Q8N6Y2 441 aa15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms