RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, human

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGEF1-209	ENST00000607882	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	CYGB	Q8WWM9	190 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	VPS33A	Q96AX1	596 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	FBXL20	Q96IG2	436 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	PCSK5	Q92824	1860 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	SGK494	L7N484	410 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	NDUFS4	O43181	175 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	PRAMEF4	O60810	478 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	C1QL1	O75973	258 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	MT-ND1	P03886	318 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	IL10	P22301	178 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	FAS	P25445	335 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	PIK3CG	P48736	1102 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	RABL3	Q5HYI8	236 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	GPR141	Q7Z602	305 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	GALNT7	Q86SF2	657 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR8H2	Q8N162	312 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	LRRC58	Q96CX6	371 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	TRIM15	Q9C019	465 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882		V9GYQ6	96 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	AQP12B	A6NM10	295 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	TMEM127	O75204	238 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	NCK1	P16333	377 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	EPB42	P16452	691 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLC26A3	P40879	764 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	CASP2	P42575	452 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	MERTK	Q12866	999 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	CYP51A1	Q16850	503 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882		A0A087WXM4	84 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882		A0A1B0GX78	115 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882		C9J4A7	227 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	EI24	O14681	340 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	MAGEB3	O15480	346 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	BMP10	O95393	424 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	ANXA5	P08758	320 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	HSD17B1	P14061	328 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	LBP	P18428	481 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	AGXT	P21549	392 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	EFNA3	P52797	238 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	DSTN	P60981	165 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	GRM7	Q14831	915 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	KANK2	Q63ZY3	851 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	LCN8	Q6JVE9	175 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	CORO6	Q6QEF8	472 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	COX15	Q7KZN9	410 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	RNF44	Q7L0R7	432 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	SPERT	Q8NA61	448 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	ISOC1	Q96CN7	298 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	TEX37	Q96LM6	180 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	RHBG	Q9H310	441 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	KLHL31	Q9H511	634 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	KCND3	Q9UK17	655 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	CENPE	Q02224	2701 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	CRCP	O75575	148 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	F10	P00742	488 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	PDGFA	P04085	211 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	FGF4	P08620	206 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	B2M	P61769	119 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	ESRRG	P62508	458 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	BNIP2	Q12982	314 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	DEFB134	Q4QY38	66 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	11.8	□□□□□ -0.52

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms