RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 C16orf72Q14CZ0 275 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC35F3Q8IY50 421 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 SPARTQ8N0X7 666 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 TBC1D19Q8N5T2 526 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKRD53Q8N9V6 530 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 PSMA8Q8TAA3 256 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 CRELD1Q96HD1 420 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 DCBLD2Q96PD2 775 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 DEPDC7Q96QD5 511 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 FERD3LQ96RJ6 166 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 U3KQV3 271 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 CPED1A4D0V7 1026 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 MYO1GB0I1T2 1018 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 hCG_2039718K7EN88 272 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 C1QCP02747 245 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 ETFAP13804 333 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 PCSK6P29122 969 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 CSNK1G2P78368 415 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 MC1RQ01726 317 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 NFATC4Q14934 902 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 ALG11Q2TAA5 492 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 SAXO2Q658L1 398 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 FGF11Q92914 225 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 PDXPQ96GD0 296 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 C12orf66Q96MD2 445 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 ABCG4Q9H172 646 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 A4GALTQ9NPC4 353 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 KRT84Q9NSB2 600 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 SAP18O00422 153 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 PDPK1O15530 556 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 NDUFS4O43181 175 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 CEACAM5P06731 702 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 ANXA8P13928 327 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 ITPKBP27987 946 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 BLKP51451 505 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 NR0B2Q15466 257 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 MEP1AQ16819 746 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 TPD52L3Q96J77 140 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM184CQ9NVA4 438 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 KIF17Q9P2E2 1029 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 ENOPH1Q9UHY7 261 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 OR1A2Q9Y585 309 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 ARRDC5A6NEK1 342 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 CSO75390 466 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 KIAA1024LP59773 190 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 DSTNP60981 165 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC5A12Q1EHB4 618 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 TBC1D25Q3MII6 688 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 COX20Q5RI15 118 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 PERM1Q5SV97 790 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 XAF1Q6GPH4 301 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 LAIR2Q6ISS4 152 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB2BQ8WUD1 216 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 RUBCNLQ9H714 662 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 SCN3BQ9NY72 215 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 NDUFAF4Q9P032 175 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 GMPPBQ9Y5P6 360 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 LOC400499M0QZD8 3231 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 PDE9AO76083 593 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 HTR1BP28222 390 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 NDUFS1P28331 727 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 AHRP35869 848 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 TSFMP43897 325 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 HMGA2P52926 109 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 ZIC1Q15915 447 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 ISXQ2M1V0 245 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 ENPP7Q6UWV6 458 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 ATG16L2Q8NAA4 619 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 LINC01555Q8NAE3 123 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 GIPC3Q8TF64 312 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 NODALQ96S42 347 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 ACAT2Q9BWD1 397 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 DUSP21Q9H596 190 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 ASXL3Q9C0F0 2248 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 GUCY1B2O75343 617 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 DXOO77932 396 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 RASGRP1O95267 797 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 ANGPTL1O95841 491 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 GBAP04062 536 aa24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms