RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MIB2Q96AX9 1013 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ELP4Q96EB1 424 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 NSL1Q96IY1 281 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 MRGPRX4Q96LA9 322 aa2.89□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF597Q96LX8 424 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 Q96MF0 132 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 GLT1D1Q96MS3 346 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 BIRC8Q96P09 236 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SIGLEC11Q96RL6 698 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TRIB1Q96RU8 372 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PAFAH2Q99487 392 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 P2RY13Q9BPV8 354 aa2.89□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 FNDC11Q9BVV2 318 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 C1orf43Q9BWL3 253 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 S1PR5Q9H228 398 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SPNS1Q9H2V7 528 aa2.89□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 UBQLN3Q9H347 655 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MEAF6Q9HAF1 191 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 USP29Q9HBJ7 922 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 LPAR2Q9HBW0 351 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ZFP14Q9HCL3 533 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 COA4Q9NYJ1 87 aa2.89□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 FAM25GB3EWG6 89 aa2.88□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 SEC24AO95486 1093 aa2.88□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 LY86O95711 162 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ANGPTL1O95841 491 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 NDUFB10O96000 172 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 GH1P01241 217 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 RLN1P04808 185 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 IFNA4P05014 189 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CDK1P06493 297 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 F7P08709 466 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 FBP1P09467 338 aa2.88□□□□□ -1.95
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