RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	TEX9	Q8N6V9	391 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	PDPR	Q8NCN5	879 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	NEIL2	Q969S2	332 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	KIAA1191	Q96A73	305 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	PTER	Q96BW5	349 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	FAR2	Q96K12	515 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	SPRY4	Q9C004	299 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	OPTC	Q9UBM4	332 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	DKK2	Q9UBU2	259 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	USP24	Q9UPU5	2620 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A1B0GX78	115 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A1W2PPM1	405 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	OR2A25	A4D2G3	310 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	MARCH11	A6NNE9	402 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288		A8MUA0	341 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	C21orf140	B9A014	251 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	MASP2	O00187	686 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	P2RX6	O15547	441 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	NDUFS4	O43181	175 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	B4GALT2	O60909	372 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	SPDEF	O95238	335 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	SHBG	P04278	402 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	PRB1	P04280	392 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	CD63	P08962	238 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	RBP1	P09455	135 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	IL1RN	P18510	177 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	TSPAN8	P19075	237 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	TAC1	P20366	129 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	ITGAX	P20702	1163 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	CNTF	P26441	200 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	HSD17B3	P37058	310 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	GABRA4	P48169	554 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	CCNG1	P51959	295 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	EMP2	P54851	167 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	VSNL1	P62760	191 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	OLR1	P78380	273 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	BTN3A2	P78410	334 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	RHD	Q02161	417 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	PIGF	Q07326	219 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	RGS1	Q08116	209 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	CDC20	Q12834	499 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	CDC16	Q13042	620 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	KLF10	Q13118	480 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	CHIT1	Q13231	466 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	TP53BP2	Q13625	1128 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	GTF2H2	Q13888	395 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	DOC2A	Q14183	400 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	PDK4	Q16654	411 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	SYVN1	Q86TM6	617 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	RAB43	Q86YS6	212 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	OR56A3	Q8NH54	315 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	ANKRD7	Q92527	254 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	NACC2	Q96BF6	587 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	MOCOS	Q96EN8	888 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	CATSPER2	Q96P56	530 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	OR2A5	Q96R48	311 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	OR4K3	Q96R72	315 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	DRC3	Q9H069	523 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		4.39	□□□□□ -1.71

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