RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533179.1

SOX9-AS1-211, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 460 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IRF4Q15306 451 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CTSL3PQ5NE16 218 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM63BQ5T3F8 832 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DOK6Q6PKX4 331 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HSDL2Q6YN16 418 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 Q6ZVL8 140 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ASB18Q6ZVZ8 466 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GDPD3Q7L5L3 318 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TSPAN33Q86UF1 283 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IRF2BP1Q8IU81 584 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TEX26Q8N6G2 289 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR56A3Q8NH54 315 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MARCH1Q8TCQ1 289 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SORCS1Q8WY21 1168 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HGDQ93099 445 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF333Q96JL9 665 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KLHDC3Q9BQ90 382 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SOX7Q9BT81 388 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KATNB1Q9BVA0 655 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TSSK1BQ9BXA7 367 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NUAK2Q9H093 628 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 WDR54Q9H977 334 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PLGRKTQ9HBL7 147 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IFT46Q9NQC8 304 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NANSQ9NR45 359 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MIOSQ9NXC5 875 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SMPXQ9UHP9 88 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF639Q9UID6 485 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DUSP13Q9UII6 198 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PSG11Q9UQ72 335 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF337Q9Y3M9 751 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MMP24Q9Y5R2 645 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 AUP1Q9Y679 476 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 A0A1B0GV72 72 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 A0A1W2PPC1 479 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 EVPLLA8MZ36 301 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 H3BN98 237 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CCRL2O00421 344 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CYP26A1O43174 497 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CCDC22O60826 627 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RAD51DO75771 328 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FADS2O95864 444 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TGFB1P01137 390 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IFNA10P01566 189 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IFNGP01579 166 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF28P17035 718 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PAICSP22234 425 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FDXRP22570 491 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DCKP27707 260 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CEACAM3P40198 252 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NDUFV1P49821 464 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DNA2P51530 1060 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ERVK-25P63136 954 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 BLOC1S1P78537 153 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DMWDQ09019 674 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ABHD18Q0P651 414 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MED21Q13503 144 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DPYSL3Q14195 570 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RBBP7Q16576 425 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GSTA3Q16772 222 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM249Q2WGJ8 235 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF699Q32M78 642 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CNPY1Q3B7I2 92 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 COX19Q49B96 90 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CBWD6Q4V339 395 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PIGGQ5H8A4 983 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CBWD3Q5JTY5 395 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM46CQ5VWP2 391 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TTC23Q5W5X9 447 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 REEP3Q6NUK4 255 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF544Q6NX49 715 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ULK3Q6PHR2 472 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C17orf99Q6UX52 265 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C17orf107Q6ZR85 190 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM92BQ6ZTR7 304 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 Q6ZUG5 572 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RRM2BQ7LG56 351 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SCD5Q86SK9 330 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR5D13Q8NGL4 314 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SPPL2AQ8TCT8 520 aa6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms