RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515948.1

RNU6-848P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 848, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-848P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-848P-201ENST00000515948 MYOGP15173 224 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 EPCAMP16422 314 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 AADACP22760 399 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 ACKR3P25106 362 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 CTNNA2P26232 953 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 PRDX6P30041 224 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 RFC2P35250 354 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 NUDT1P36639 197 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 TNFRSF4P43489 277 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 KCNJ4P48050 445 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 GSSP48637 474 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 PITPNBP48739 271 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 FHITP49789 147 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 ARHGDIAP52565 204 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 APOC4P55056 127 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 KRTAP12-1P59990 96 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 PRPS1P60891 318 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 KRT83P78385 493 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 SRPXP78539 464 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 ROR1Q01973 937 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 NAAAQ02083 359 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 PAX5Q02548 391 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 HSPB3Q12988 150 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 GPR50Q13585 617 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 SERTAD2Q14140 314 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 CRYMQ14894 314 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 KIAA0040Q15053 153 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 SPHARQ15513 63 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 ZIC1Q15915 447 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 ZNF699Q32M78 642 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 ALFQ53S48 1182 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 CCDC158Q5M9N0 1113 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 VAX1Q5SQQ9 334 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 PHYHD1Q5SRE7 291 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 MUC21Q5SSG8 566 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 LDLRAP1Q5SW96 308 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 HECTD3Q5T447 861 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 SLC22A10Q63ZE4 541 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 C1orf94Q6P1W5 598 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 C1orf186Q6ZWK4 172 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 GDPD3Q7L5L3 318 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 BNIPLQ7Z465 357 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 DNAAF5Q86Y56 855 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 SMC5Q8IY18 1101 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 PEX5LQ8IYB4 626 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 SAXO1Q8IYX7 474 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 C6orf223Q8N319 242 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 GPR137CQ8N3F9 429 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 FAM89BQ8N5H3 189 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 ZNF525Q8N782 197 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 TMEM99Q8N816 258 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 SAMD12Q8N8I0 201 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 ZFP41Q8N8Y5 198 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 Q8N9W7 124 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 POGLUT1Q8NBL1 392 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 RNF149Q8NC42 400 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 NAXEQ8NCW5 288 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 OR10G2Q8NGC3 310 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 OR52J3Q8NH60 311 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 TBCKQ8TEA7 893 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 FAM151AQ8WW52 585 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 RAD54LQ92698 747 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 P3H4Q92791 437 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 OTULINQ96BN8 352 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 MOB3AQ96BX8 217 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 BIRC7Q96CA5 298 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 PGM2Q96G03 612 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 PGAM5Q96HS1 289 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 CCDC136Q96JN2 1154 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 CEP170P1Q96L14 293 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 B3GALT6Q96L58 329 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 KCNA7Q96RP8 456 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 SLF1Q9BQI6 1058 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 EBF4Q9BQW3 602 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 APOOQ9BUR5 198 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 PINK1Q9BXM7 581 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 CACNG6Q9BXT2 260 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 PANK2Q9BZ23 570 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 OSBPL8Q9BZF1 889 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 CHIAQ9BZP6 476 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-848P-201ENST00000515948 MIS12Q9H081 205 aa0.09□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms