RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482439.6

TBC1D15-208, Transcript of TBC1 domain family member 15, human

TSL 5

Gene TBC1D15, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBC1D15-208	ENST00000482439	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	CHST8	Q9H2A9	424 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	ALG2	Q9H553	416 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	NTM	Q9P121	344 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	MEN1	O00255	615 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	DNAJA2	O60884	412 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	KCNK5	O95279	499 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	MAOA	P21397	527 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	GPC1	P35052	558 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	SOAT1	P35610	550 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	RHAG	Q02094	409 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	SLC13A2	Q13183	592 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	ADRM1	Q16186	407 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	FHL5	Q5TD97	284 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	TMEM107	Q6UX40	140 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	OR7G2	Q8NG99	324 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	SFXN5	Q8TD22	340 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	NETO1	Q8TDF5	533 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	DOK4	Q8TEW6	326 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	LRFN5	Q96NI6	719 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	TAAR9	Q96RI9	348 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	SPRY4	Q9C004	299 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	CTSF	Q9UBX1	484 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	SPEG	Q15772	3267 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	UPK1A	O00322	258 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	EMC8	O43402	210 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	TNFRSF21	O75509	655 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	CIB2	O75838	187 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	KRT75	O95678	551 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	CT62	P0C5K7	136 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	CEACAM1	P13688	526 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	S1PR1	P21453	382 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	MC3R	P41968	323 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	MAPK10	P53779	464 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	CASP9	P55211	416 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	VAC14	Q08AM6	782 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	STX4	Q12846	297 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	MAP4K2	Q12851	820 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	CCNI	Q14094	377 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	SERPINA11	Q86U17	422 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	RNF130	Q86XS8	419 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	PTOV1	Q86YD1	416 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	ZNF675	Q8TD23	568 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	ASB9	Q96DX5	294 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	MAGED4	Q96JG8	741 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	PISD	Q9UG56	409 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	ZNF639	Q9UID6	485 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	ACACB	O00763	2458 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	SLC30A4	O14863	429 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	PLD2	O14939	933 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TBC1D15-208	ENST00000482439	PLOD3	O60568	738 aa		13.16	□□□□□ -0.3

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms