RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 TNFRSF19Q9NS68 423 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 THYN1Q9P016 225 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 NAV2Q8IVL1 2488 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 LTN1O94822 1766 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 BCORQ6W2J9 1755 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 TJP1Q07157 1748 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 TPRP12270 2363 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 KDM3BQ7LBC6 1761 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 ILVBLA1L0T0 632 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 FGF19O95750 216 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 RLN1P04808 185 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM200BP0CF97 657 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 ELK3P41970 407 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 PEX3P56589 373 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 BACE1P56817 501 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 RBBP4Q09028 425 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 ECSCRQ19T08 205 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 TEX35Q5T0J7 233 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 CASC4Q6P4E1 433 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 HIPK1Q86Z02 1210 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 CREBRFQ8IUR6 639 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 TBC1D10CQ8IV04 446 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 CARNMT1Q8N4J0 409 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 OR1B1Q8NGR6 318 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 OR13C5Q8NGS8 318 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 KIAA1524Q8TCG1 905 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 RAET1EQ8TD07 263 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 SMPDL3AQ92484 453 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 DNASE1L2Q92874 299 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 PINK1Q9BXM7 581 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 VIPAS39Q9H9C1 493 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 SH3GLB2Q9NR46 395 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 DEPPQ9NTK1 212 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 B4GALT7Q9UBV7 327 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 MGAT4AQ9UM21 535 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 CELA1Q9UNI1 258 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 ACACBO00763 2458 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-206ENST00000467748 PIK3C2GO75747 1445 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 REV3LO60673 3130 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 CARMIL3Q8ND23 1372 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 IGLON5A6NGN9 336 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 ACSL4O60488 711 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 IGHG3P01860 377 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 IFNAR1P17181 557 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 HOXD10P28358 340 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 RIPPLY3P57055 190 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 KRTAP10-8P60410 259 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 CEACAM7Q14002 265 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 PSMD6Q15008 389 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 NHLRC3Q5JS37 347 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF506Q5JVG8 444 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 MUC21Q5SSG8 566 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 OLFML2AQ68BL7 652 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 NEPROQ6NW34 567 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 TRAT1Q6PIZ9 186 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 PET117Q6UWS5 81 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 LRRC49Q8IUZ0 686 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 THNSL1Q8IYQ7 743 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC43A2Q8N370 569 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 C11orf42Q8N5U0 333 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 SAP25Q8TEE9 199 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 CKAP2Q8WWK9 683 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC35C1Q96A29 364 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 BPIFA2Q96DR5 249 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 INTS14Q96SY0 518 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 C17orf62Q9BQA9 187 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 IDI2Q9BXS1 227 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 LIME1Q9H400 295 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 C11orf49Q9H6J7 331 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 CLEC5AQ9NY25 188 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 ABCD2Q9UBJ2 740 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 GIMAP2Q9UG22 337 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 ITGA11Q9UKX5 1188 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 SH3GLB1Q9Y371 365 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 SSC5DA1L4H1 1573 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 KIF1BO60333 1816 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 COL4A6Q14031 1691 aa3.01□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 PFASO15067 1338 aa3.01□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms