RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460331.5

ZNF3-211, Transcript of zinc finger protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF3, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3-211ENST00000460331 SH3GL1Q99961 368 aa11.67□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 SLAMF7Q9NQ25 335 aa11.67□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP11.67□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 WDR70Q9NW82 654 aa11.67□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 PTGFRNQ9P2B2 879 aa11.67□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 CLDN16Q9Y5I7 305 aa11.67□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 CEP250Q9BV73 2442 aa11.67□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 NUP210LQ5VU65 1888 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 A0A087WV62 115 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 ASPDHA6ND91 283 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 A8MUA0 341 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 B2RBV5 119 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 C17orf105B2RV13 164 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 TGFBR3LH3BV60 316 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 TERTO14746 1132 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 KRT75O95678 551 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 UMODP07911 640 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 CD1EP15812 388 aa11.66□□□□□ -0.54
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ZNF3-211ENST00000460331 CCT3P49368 545 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
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ZNF3-211ENST00000460331 DUSP2Q05923 314 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 SPRED3Q2MJR0 410 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 SFT2D3Q587I9 215 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 TMEM64Q6YI46 380 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 ARPINQ7Z6K5 226 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 RETREG3Q86VR2 466 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 VWA5B2Q8N398 1253 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 MORN4Q8NDC4 146 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 ZNF248Q8NDW4 579 aa11.66□□□□□ -0.54
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ZNF3-211ENST00000460331 OR9A2Q8NGT5 310 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 SFXN5Q8TD22 340 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 ELP4Q96EB1 424 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 PHF12Q96QT6 1004 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 INPP5KQ9BT40 448 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 RAD21L1Q9H4I0 556 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 CXorf21Q9HAI6 301 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 SERHLQ9NQF3 203 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 MAT2BQ9NZL9 334 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 MAP10Q9P2G4 905 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 AP3M1Q9Y2T2 418 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 SNX8Q9Y5X2 465 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 A0A1W2PS29 197 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 EVPLLA8MZ36 301 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 PEX12O00623 359 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 PLOD3O60568 738 aa11.65□□□□□ -0.54
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ZNF3-211ENST00000460331 CREG1O75629 220 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 UNC5CO95185 931 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 T-ENOLP0DO92 83 aa11.65□□□□□ -0.54
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ZNF3-211ENST00000460331 PGDP52209 483 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 RPS18P62269 152 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 LTB4RQ15722 352 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 ZNF628Q5EBL2 1059 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 TMEM107Q6UX40 140 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 LANCL3Q6ZV70 420 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 NUP43Q8NFH3 380 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 ADCY4Q8NFM4 1077 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 OR7G1Q8NGA0 311 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 KCNE4Q8WWG9 221 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 KAT2AQ92830 837 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 CTHRC1Q96CG8 243 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 LRRC58Q96CX6 371 aa11.65□□□□□ -0.54
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ZNF3-211ENST00000460331 SLC35A5Q9BS91 424 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 DPH1Q9BZG8 443 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 C1orf21Q9H246 121 aa11.65□□□□□ -0.54
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ZNF3-211ENST00000460331 CXorf36Q9H7Y0 433 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 IL1RL2Q9HB29 575 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 DKK4Q9UBT3 224 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 COPS7AQ9UBW8 275 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 CORO2BQ9UQ03 480 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 CFL2Q9Y281 166 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 SDK2Q58EX2 2172 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF3-211ENST00000460331 SEC16AO15027 2179 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF3-211ENST00000460331 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF3-211ENST00000460331 SAGE2PA6NJ88 616 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF3-211ENST00000460331 CLIC1O00299 241 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF3-211ENST00000460331 SOX30O94993 753 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF3-211ENST00000460331 GSNP06396 782 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF3-211ENST00000460331 ICAM2P13598 275 aa11.64□□□□□ -0.55
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