RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 PTP4A2Q12974 167 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 NFE2L1Q14494 772 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF750Q32MQ0 723 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 OLFML2AQ68BL7 652 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC18B1Q6NT16 456 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM180BQ6P0A1 224 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 PRMT9Q6P2P2 845 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF66Q6ZN08 573 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 NT5DC3Q86UY8 548 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 NLRP14Q86W24 1093 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 AMZ2Q86W34 360 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 EMC1Q8N766 993 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM156AQ8NDB6 213 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 ACVR1CQ8NER5 493 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC44A1Q8WWI5 657 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC25A28Q96A46 364 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 SCRN2Q96FV2 425 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 TEKT5Q96M29 485 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 FOXN4Q96NZ1 517 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 KRT12Q99456 494 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 ALG8Q9BVK2 526 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 PACSIN1Q9BY11 444 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 XKR8Q9H6D3 395 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 IL1RL2Q9HB29 575 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 BEX1Q9HBH7 125 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 PLAC1Q9HBJ0 212 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 PANK4Q9NVE7 773 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM248Q9NWD8 314 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 HIF1ANQ9NWT6 349 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 SPHK1Q9NYA1 384 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 KLHL20Q9Y2M5 609 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 DOCK7Q96N67 2140 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 A0A0J9YY10 115 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 A0A1B0GUS0 222 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 ARHGEF33A8MVX0 844 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 F5H697 171 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 J3KR12 359 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 M0R3H8 397 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 NDUFS8O00217 210 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 HSF2BPO75031 334 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 FESP07332 822 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 SELEP16581 610 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 NDUFS1P28331 727 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 GTF2H1P32780 548 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 MTNR1BP49286 362 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 SULT1E1P49888 294 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 DEUP1Q05D60 604 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 CCNIQ14094 377 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 AGAP6Q5VW22 663 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 AWAT2Q6E213 333 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 DTX2Q86UW9 622 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 PM20D2Q8IYS1 436 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 OR8H2Q8N162 312 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 MIER2Q8N344 545 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 IL17RDQ8NFM7 739 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 KBTBD8Q8NFY9 601 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 NEIL3Q8TAT5 605 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 ADAMTS15Q8TE58 950 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 RFKQ969G6 155 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 TADA1Q96BN2 335 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 FAHD2AQ96GK7 314 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 SNX18Q96RF0 628 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 WDR24Q96S15 920 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 CYTH2Q99418 400 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 SELENOSQ9BQE4 189 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC39A3Q9BRY0 314 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 SPATA16Q9BXB7 569 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 BPESC1Q9GZL8 116 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 VN1R1Q9GZP7 353 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM83DQ9H4H8 585 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 LPAR2Q9HBW0 351 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 ELOVL5Q9NYP7 299 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 EHD3Q9NZN3 535 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 SH3BP4Q9P0V3 963 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 KIAA1257Q9ULG3 409 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 GRID1Q9ULK0 1009 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-203ENST00000459697 SH2B3Q9UQQ2 575 aa4.13□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms