RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447117.1

PTENP1-201, Transcript of phosphatase and tensin homolog pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PTENP1, Length 1,215 nt, Biotype transcribed processed pseudogene, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP1-201ENST00000447117 NDST1P52848 882 aa3.3□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 HMGCS2P54868 508 aa3.3□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 GEMP55040 296 aa3.3□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 CRMP1Q14194 572 aa3.3□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 TRADDQ15628 312 aa3.3□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 CNPY1Q3B7I2 92 aa3.3□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 UNC50Q53HI1 259 aa3.3□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 RTL6Q6ICC9 239 aa3.3□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 MOB2Q70IA6 237 aa3.3□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa3.3□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 C5orf30Q96GV9 206 aa3.3□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 SERAC1Q96JX3 654 aa3.3□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa3.3□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 FAM213AQ9BRX8 229 aa3.3□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 DESI2Q9BSY9 194 aa3.3□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 IL1RL2Q9HB29 575 aa3.3□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 SLC25A19Q9HC21 320 aa3.3□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 VPS54Q9P1Q0 977 aa3.3□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 ARMCX1Q9P291 453 aa3.3□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa3.3□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 AFF2P51816 1311 aa3.29□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 A0A0A6YYD4 124 aa3.29□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 FAM168BA1KXE4 195 aa3.29□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 LRRTM2O43300 516 aa3.29□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 UMPSP11172 480 aa3.29□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 TNFRSF4P43489 277 aa3.29□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 LTB4RQ15722 352 aa3.29□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 ZNF674Q2M3X9 581 aa3.29□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 SLC39A12Q504Y0 691 aa3.29□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 ODF2Q5BJF6 829 aa3.29□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 MARC1Q5VT66 337 aa3.29□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 PAMR1Q6UXH9 720 aa3.29□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 CD177Q8N6Q3 437 aa3.29□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa3.29□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 EEF2KMTQ96G04 330 aa3.29□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 CXorf58Q96LI9 332 aa3.29□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 PRAM1Q96QH2 718 aa3.29□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 FUNDC2Q9BWH2 189 aa3.29□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 TMEM245Q9H330 911 aa3.29□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 FAM205AQ6ZU69 1335 aa3.28□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 SMIM30A4D0T7 59 aa3.28□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 RHBDL1O75783 438 aa3.28□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 NUDT14O95848 222 aa3.28□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 GOT2P00505 430 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 NME5P56597 212 aa3.28□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 HERV-K104P63124 156 aa3.28□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 RNF212Q495C1 297 aa3.28□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 SLC22A6Q4U2R8 563 aa3.28□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 FHL5Q5TD97 284 aa3.28□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 TAF3Q5VWG9 929 aa3.28□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa3.28□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 ASRGL1Q7L266 308 aa3.28□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 CCDC91Q7Z6B0 441 aa3.28□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 IQCA1Q86XH1 822 aa3.28□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 CCDC170Q8IYT3 715 aa3.28□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 LINC00518Q8N0U6 118 aa3.28□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 DCTPP1Q9H773 170 aa3.28□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 DCLRE1BQ9H816 532 aa3.28□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 DNAJC11Q9NVH1 559 aa3.28□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 COMMD8Q9NX08 183 aa3.28□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 IMPAD1Q9NX62 359 aa3.28□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 TAS2R16Q9NYV7 291 aa3.28□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 RAI14Q9P0K7 980 aa3.28□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 NARFQ9UHQ1 456 aa3.28□□□□□ -1.88
PTENP1-201ENST00000447117 C5orf51A6NDU8 294 aa3.27□□□□□ -1.89
PTENP1-201ENST00000447117 PRAMEF12O95522 483 aa3.27□□□□□ -1.89
PTENP1-201ENST00000447117 IGHG3P01860 377 aa3.27□□□□□ -1.89
PTENP1-201ENST00000447117 APRTP07741 180 aa3.27□□□□□ -1.89
PTENP1-201ENST00000447117 NSFP46459 744 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTENP1-201ENST00000447117 FNTAP49354 379 aa3.27□□□□□ -1.89
PTENP1-201ENST00000447117 TKTL1P51854 596 aa3.27□□□□□ -1.89
PTENP1-201ENST00000447117 SLC7A2P52569 658 aa3.27□□□□□ -1.89
PTENP1-201ENST00000447117 SMSP52788 366 aa3.27□□□□□ -1.89
PTENP1-201ENST00000447117 MFAP2P55001 183 aa3.27□□□□□ -1.89
PTENP1-201ENST00000447117 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
PTENP1-201ENST00000447117 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
PTENP1-201ENST00000447117 PDE7AQ13946 482 aa3.27□□□□□ -1.89
PTENP1-201ENST00000447117 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTENP1-201ENST00000447117 KRT31Q15323 416 aa3.27□□□□□ -1.89
PTENP1-201ENST00000447117 EPC2Q52LR7 807 aa3.27□□□□□ -1.89
PTENP1-201ENST00000447117 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa3.27□□□□□ -1.89
PTENP1-201ENST00000447117 STEAP1BQ6NZ63 245 aa3.27□□□□□ -1.89
PTENP1-201ENST00000447117 MFSD7Q6UXD7 560 aa3.27□□□□□ -1.89
PTENP1-201ENST00000447117 STOX1Q6ZVD7 989 aa3.27□□□□□ -1.89
PTENP1-201ENST00000447117 UNC45BQ8IWX7 931 aa3.27□□□□□ -1.89
PTENP1-201ENST00000447117 C11orf53Q8IXP5 236 aa3.27□□□□□ -1.89
PTENP1-201ENST00000447117 OR4A16Q8NH70 328 aa3.27□□□□□ -1.89
PTENP1-201ENST00000447117 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTENP1-201ENST00000447117 BIRC7Q96CA5 298 aa3.27□□□□□ -1.89
PTENP1-201ENST00000447117 RAB39BQ96DA2 213 aa3.27□□□□□ -1.89
PTENP1-201ENST00000447117 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTENP1-201ENST00000447117 PPP1R16AQ96I34 528 aa3.27□□□□□ -1.89
PTENP1-201ENST00000447117 COG3Q96JB2 828 aa3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms