RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429490.5

SGMS1-203, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 3,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGMS1-203ENST00000429490 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP13.06□□□□□ -0.327e-7■■■□□ 17.8
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SGMS1-203ENST00000429490 CXorf36Q9H7Y0 433 aa13.06□□□□□ -0.32
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SGMS1-203ENST00000429490 SLC27A4Q6P1M0 643 aa13.06□□□□□ -0.32
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SGMS1-203ENST00000429490 OPALINQ96PE5 141 aa13.06□□□□□ -0.32
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SGMS1-203ENST00000429490 ABCG4Q9H172 646 aa13.06□□□□□ -0.32
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SGMS1-203ENST00000429490 C10orf53Q8N6V4 93 aa13.05□□□□□ -0.32
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SGMS1-203ENST00000429490 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
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SGMS1-203ENST00000429490 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
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SGMS1-203ENST00000429490 HSD3B2P26439 372 aa13.05□□□□□ -0.32
SGMS1-203ENST00000429490 SLC6A12P48065 614 aa13.05□□□□□ -0.32
SGMS1-203ENST00000429490 GIPRP48546 466 aa13.05□□□□□ -0.32
SGMS1-203ENST00000429490 GZMMP51124 257 aa13.05□□□□□ -0.32
SGMS1-203ENST00000429490 CLCNKAP51800 687 aa13.05□□□□□ -0.32
SGMS1-203ENST00000429490 GPR19Q15760 415 aa13.05□□□□□ -0.32
SGMS1-203ENST00000429490 CCDC28AQ8IWP9 274 aa13.05□□□□□ -0.32
SGMS1-203ENST00000429490 CDK20Q8IZL9 346 aa13.05□□□□□ -0.32
SGMS1-203ENST00000429490 OR5AR1Q8NGP9 310 aa13.05□□□□□ -0.32
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