RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 COL28A1Q2UY09 1125 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 BTBD16Q32M84 506 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 GTDC1Q4AE62 458 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM177Q53S58 311 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 PYDC2Q56P42 97 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 FBXO48Q5FWF7 155 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 C10orf120Q5SQS8 335 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 RAP1GAP2Q684P5 730 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 FBXL22Q6P050 247 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 LILRA6Q6PI73 481 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF621Q6ZSS3 439 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 GPR155Q7Z3F1 870 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CAMKMTQ7Z624 323 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 AMIGO1Q86WK6 493 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SYT12Q8IV01 421 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 LGI4Q8N135 537 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ZBTB2Q8N680 514 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SPPL2AQ8TCT8 520 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 POF1BQ8WVV4 589 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ESAMQ96AP7 390 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 EGLN2Q96KS0 407 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 NEDD4LQ96PU5 975 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 HBEGFQ99075 208 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 INPP5KQ9BT40 448 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ACAT2Q9BWD1 397 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 UCK2Q9BZX2 261 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SEMA6CQ9H3T2 930 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 TPT1P8Q9HAU6 139 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 FZD3Q9NPG1 666 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 PLSCR3Q9NRY6 295 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 AASSQ9UDR5 926 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ITM2BQ9Y287 266 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ASB1Q9Y576 335 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 AUP1Q9Y679 476 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF840PA6NDX5 716 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 FAM170BA6NMN3 283 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ZAR1LA6NP61 321 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 LOC730098B7Z3J9 87 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 F5H5T6 163 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SGK494L7N484 410 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 FFAR3O14843 346 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SLC30A4O14863 429 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 GPR42O15529 346 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TAPBPO15533 448 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TGM5O43548 720 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 PRKYO43930 277 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 GPX5O75715 221 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 C8GP07360 202 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CSF3P09919 207 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 PSKH1P11801 424 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 COX7A2P14406 83 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SDC1P18827 310 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 HIST1H2ADP20671 130 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ITGALP20701 1170 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 IL32P24001 234 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 PREPP48147 710 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SMIM11AP58511 58 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 RAB14P61106 215 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CYP4F2P78329 520 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 EFEMP1Q12805 493 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 LAPTM4AQ15012 233 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 GPR33Q49SQ1 333 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ALFQ53S48 1182 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SAXO2Q658L1 398 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM40Q6P9F5 258 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CASP12Q6UXS9 341 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 VTCN1Q7Z7D3 282 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 LUZP2Q86TE4 346 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 FAM124AQ86V42 546 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 PTOV1Q86YD1 416 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 LAX1Q8IWV1 398 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 GHDCQ8N2G8 530 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 LINC00471Q8N535 108 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ESX1Q8N693 406 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SLC5A8Q8N695 610 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC17Q8N6Y2 441 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 L3MBTL4Q8NA19 623 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 OR4C15Q8NGM1 316 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 RNF141Q8WVD5 230 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 AUTS2Q8WXX7 1259 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 Q96M66 194 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 OPALINQ96PE5 141 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 PIP5K1AQ99755 562 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 H2AFJQ9BTM1 129 aa6.83□□□□□ -1.32
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