RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 A0A0X1KG70 313 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 J3QLW9 94 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 SDC3O75056 442 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 ZNF19P17023 458 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 CENPAP49450 140 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 RAB11FIP2Q7L804 512 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 KRT77Q7Z794 578 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 TM9SF4Q92544 642 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 ARMC5Q96C12 935 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 GAL3ST1Q99999 423 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 SLC6A17Q9H1V8 727 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 RLIMQ9NVW2 624 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 ENPP4Q9Y6X5 453 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 F5H0A9 414 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 I6L893 689 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 GPR17Q13304 367 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 SLC22A10Q63ZE4 541 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 TMED4Q7Z7H5 227 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 PIGXQ8TBF5 258 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 CREB3L4Q8TEY5 395 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 FBXL2Q9UKC9 423 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 RREB1Q92766 1687 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 H7C0S8 307 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 E2F3O00716 465 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 SNAPC5O75971 98 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 VEZF1Q14119 521 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 TAF13Q15543 124 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 Q5BKY6 102 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 ZFP82Q8N141 532 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 CLRN3Q8NCR9 226 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 FAM86C2PA6NEL3 165 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 ADAP00813 363 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 TACR1P25103 407 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 ITGA3P26006 1051 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 S100A2P29034 98 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 MNDAP41218 407 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 BTG1P62324 171 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 P2RY14Q15391 338 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 NLRC3Q7RTR2 1065 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 SLC30A8Q8IWU4 369 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 MS4A15Q8N5U1 240 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 HERVK_113Q902F9 699 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 RAB8BQ92930 207 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 MFFQ9GZY8 342 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 SNX11Q9Y5W9 270 aa15.85■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 ZNF98A6NK75 572 aa15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 LDB2O43679 373 aa15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 PRSS23O95084 383 aa15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 SEMG2Q02383 582 aa15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 LIPIQ6XZB0 460 aa15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 GPR155Q7Z3F1 870 aa15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 OR51I1Q9H343 314 aa15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 IQCF3P0C7M6 154 aa15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 CBR1P16152 277 aa15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 SDC1P18827 310 aa15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 CCR6P51684 374 aa15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 METTL11BQ5VVY1 283 aa15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 CD276Q5ZPR3 534 aa15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 FBXL22Q6P050 247 aa15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 ZNF527Q8NB42 609 aa15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 OPALINQ96PE5 141 aa15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 CRTAC1Q9NQ79 661 aa15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 A0A0G2JMP0 313 aa15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 SOWAHBA6NEL2 793 aa15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 CD2P06729 351 aa15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP15.84■□□□□ 0.131e-7■■■■■ 37.4
PACS1-201ENST00000320580 CTXN3Q4LDR2 81 aa15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 GPRC6AQ5T6X5 926 aa15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 PAQR6Q6TCH4 344 aa15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 CRTC1Q6UUV9 634 aa15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 OR4M2Q8NGB6 313 aa15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 CRB3Q9BUF7 120 aa15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 ASF1BQ9NVP2 202 aa15.84■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 OR6C75A6NL08 312 aa15.83■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 M0R036 132 aa15.83■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 SNX33Q8WV41 574 aa15.83■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 RAD51AP1Q96B01 352 aa15.83■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 CHFRQ96EP1 664 aa15.83■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 SEC22CQ9BRL7 303 aa15.83■□□□□ 0.13
PACS1-201ENST00000320580 TMEM43Q9BTV4 400 aa15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms