RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 SCRN2Q96FV2 425 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 ZDHHC12Q96GR4 267 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 PAAF1Q9BRP4 392 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF350Q9GZX5 532 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 RNH1P13489 461 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 CBLP22681 906 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 DNASE1P24855 282 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM107Q6UX40 140 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF283Q8N7M2 679 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 OR13J1Q8NGT2 312 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 PEX12O00623 359 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 FCER2P06734 321 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 AK4P27144 223 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 TAS2R38P59533 333 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 GRM2Q14416 872 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 VTCN1Q7Z7D3 282 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 KLBQ86Z14 1044 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF440Q8IYI8 595 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 GATAD2BQ8WXI9 593 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 FOLH1BQ9HBA9 442 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 UBQLN2Q9UHD9 624 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 PLCL2Q9UPR0 1127 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 FBP2O00757 339 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 CTBP2P56545 445 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 DCDC5Q6ZRR9 648 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 CLECL1Q8IZS7 167 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 FKBP10Q96AY3 582 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 ECHDC3Q96DC8 303 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM19Q96HH6 336 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 GSTO2Q9H4Y5 243 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 HSPA12AO43301 675 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 OR7A10O76100 309 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 H2BFMP0C1H6 154 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 T-ENOLP0DO92 83 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 MTNR1AP48039 350 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 UGT2A3Q6UWM9 527 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC28AQ8IWP9 274 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 HHATLQ9HCP6 504 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 ACSL6Q9UKU0 697 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 WASF3Q9UPY6 502 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 DHDHQ9UQ10 334 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 RFPL2O75678 378 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 LAMP1P11279 417 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 MS4A2Q01362 244 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 UGDHO60701 494 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 JRKO75564 520 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 GNAO1P09471 354 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 H2AFB2P0C5Z0 115 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 RPS26P62854 115 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 PROX2Q3B8N5 592 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 GRHL2Q6ISB3 625 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 GPR83Q9NYM4 423 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 EPHA6Q9UF33 1036 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 FAM221BA6H8Z2 402 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 K7ERQ8 282 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 PORP16435 677 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 CLRN1P58418 232 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM225Q6GV28 225 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 TMPRSS12Q86WS5 348 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 SLC5A8Q8N695 610 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 OR4K5Q8NGD3 323 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 ACOT13Q9NPJ3 140 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM184CQ9NVA4 438 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 OR2B3O76000 313 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 FARS2O95363 451 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 PTTG1O95997 202 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 GPAT4Q86UL3 456 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 C16orf78Q8WTQ4 265 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM246Q9BRR3 403 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 FANCFQ9NPI8 374 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 DKKL1Q9UK85 242 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 PADI2Q9Y2J8 665 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PP55 124 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 C11orf98E9PRG8 122 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 WDR45BQ5MNZ6 344 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM151AQ8N4L1 468 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 FIBINQ8TAL6 211 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 SYT11Q9BT88 431 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 DHRS4Q9BTZ2 278 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 NOX1Q9Y5S8 564 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 TP53I11O14683 189 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 APBB3O95704 486 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 CFL1P23528 166 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 GK3PQ14409 553 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 KATNBL1Q9H079 304 aa20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms