RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639496.1

KCNQ3-208, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3, human

TSL 5

Gene KCNQ3, Length 4,943 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KCNQ3-208	ENST00000639496	KAT14	Q9H8E8	782 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	JDP2	Q8WYK2	163 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	GOLIM4	O00461	696 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	IL2RB	P14784	551 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	CUL7	Q14999	1698 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	SPC24	Q8NBT2	197 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	FERMT3	Q86UX7	667 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	BACH2	Q9BYV9	841 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	MAP3K11	Q16584	847 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	ANKRD62	A6NC57	917 aa		11.92	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496		B4DLN1	442 aa		11.92	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		11.92	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	SNRK	Q9NRH2	765 aa		11.92	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	IL16	Q14005	1332 aa		11.92	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	AMPD3	Q01432	767 aa		11.92	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	CFAP100	Q494V2	611 aa		11.92	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	ERLIN1	O75477	346 aa		11.92	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		11.92	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		11.92	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	CALML4	Q96GE6	196 aa		11.92	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	STX8	Q9UNK0	236 aa		11.92	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		11.92	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		11.91	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		11.91	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	KIAA1328	Q86T90	577 aa		11.91	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	11.91	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		11.91	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496		H0YHG0	523 aa		11.91	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		11.91	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		11.91	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	ALDH1L1	O75891	902 aa		11.91	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	ATP2B3	Q16720	1220 aa		11.91	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		11.91	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	IL27	Q8NEV9	243 aa		11.91	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	UBA7	P41226	1012 aa		11.9	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	SPA17	Q15506	151 aa		11.9	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	NCOA7	Q8NI08	942 aa		11.9	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	GNAQ	P50148	359 aa		11.9	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	COPS6	Q7L5N1	327 aa		11.9	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	TMTC2	Q8N394	836 aa		11.9	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		11.9	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	DRC1	Q96MC2	740 aa		11.9	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	EYA3	Q99504	573 aa		11.9	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	ANO10	Q9NW15	660 aa		11.9	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		11.9	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		11.9	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		11.9	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	SAMM50	Q9Y512	469 aa		11.9	□□□□□ -0.5
KCNQ3-208	ENST00000639496	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		11.9	□□□□□ -0.51
KCNQ3-208	ENST00000639496	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.51
KCNQ3-208	ENST00000639496	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.51
KCNQ3-208	ENST00000639496	USP16	Q9Y5T5	823 aa		11.89	□□□□□ -0.51
KCNQ3-208	ENST00000639496	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
KCNQ3-208	ENST00000639496	PLCG2	P16885	1265 aa		11.89	□□□□□ -0.51
KCNQ3-208	ENST00000639496	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		11.89	□□□□□ -0.51
KCNQ3-208	ENST00000639496	ASXL2	Q76L83	1435 aa		11.89	□□□□□ -0.51
KCNQ3-208	ENST00000639496	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
KCNQ3-208	ENST00000639496	ANAPC15	P60006	121 aa		11.89	□□□□□ -0.51
KCNQ3-208	ENST00000639496	IDE	P14735	1019 aa		11.89	□□□□□ -0.51
KCNQ3-208	ENST00000639496	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
KCNQ3-208	ENST00000639496	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		11.89	□□□□□ -0.51
KCNQ3-208	ENST00000639496	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		11.89	□□□□□ -0.51
KCNQ3-208	ENST00000639496	MBIP	Q9NS73	344 aa		11.89	□□□□□ -0.51
KCNQ3-208	ENST00000639496	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		11.89	□□□□□ -0.51
KCNQ3-208	ENST00000639496	TRIM27	P14373	513 aa		11.88	□□□□□ -0.51
KCNQ3-208	ENST00000639496	HSPA2	P54652	639 aa		11.88	□□□□□ -0.51
KCNQ3-208	ENST00000639496	ESR2	Q92731	530 aa		11.88	□□□□□ -0.51
KCNQ3-208	ENST00000639496	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
KCNQ3-208	ENST00000639496	PLCH2	O75038	1416 aa		11.88	□□□□□ -0.51
KCNQ3-208	ENST00000639496	CTAGE5	O15320	804 aa		11.88	□□□□□ -0.51
KCNQ3-208	ENST00000639496	ERMN	Q8TAM6	284 aa		11.88	□□□□□ -0.51
KCNQ3-208	ENST00000639496	CYP7A1	P22680	504 aa		11.88	□□□□□ -0.51
KCNQ3-208	ENST00000639496	KRT23	Q9C075	422 aa		11.88	□□□□□ -0.51
KCNQ3-208	ENST00000639496	A2M	P01023	1474 aa		11.88	□□□□□ -0.51
KCNQ3-208	ENST00000639496	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
KCNQ3-208	ENST00000639496	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
KCNQ3-208	ENST00000639496	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51

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