RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 TAF4BQ92750 862 aa23.46■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 KAT14Q9H8E8 782 aa23.46■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.46■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 ANKRD62A6NC57 917 aa23.46■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa23.46■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 IQCEQ6IPM2 695 aa23.46■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 CFAP100Q494V2 611 aa23.45■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 TRIM27P14373 513 aa23.45■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 GUCY1B3Q02153 619 aa23.45■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 FKBP15Q5T1M5 1219 aa23.45■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 CETN2P41208 172 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 KIF20AO95235 890 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM67Q5HYA8 995 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 CAMK4Q16566 473 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 MFSD6Q6ZSS7 791 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 HDAC9Q9UKV0 1011 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC150Q8NCX0 1101 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 VAT1LQ9HCJ6 419 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 PLCH2O75038 1416 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
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CTDP1-208ENST00000613122 NLRP3Q96P20 1036 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 H0YHG0 523 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 KLHL10Q6JEL2 608 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 IL16Q14005 1332 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 A2MP01023 1474 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 ANXA1P04083 346 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 CCT2P78371 535 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 MPNDQ8N594 471 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC191Q8NCU4 936 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 ERLIN1O75477 346 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC112Q8NEF3 446 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 LIG1P18858 919 aa23.39■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.39■■□□□ 1.34
CTDP1-208ENST00000613122 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa23.39■■□□□ 1.34
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CTDP1-208ENST00000613122 MAP7D2Q96T17 732 aa23.39■■□□□ 1.33
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CTDP1-208ENST00000613122 CALML4Q96GE6 196 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 GRPEL1Q9HAV7 217 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 VPS36Q86VN1 386 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 HAND2P61296 217 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 USP16Q9Y5T5 823 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 NYXQ9GZU5 481 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 MCM4P33991 863 aa23.37■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 SLC39A6Q13433 755 aa23.37■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 OGFOD1Q8N543 542 aa23.37■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa23.37■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 COPS6Q7L5N1 327 aa23.37■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 FBLN1P23142 703 aa23.37■■□□□ 1.33
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CTDP1-208ENST00000613122 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.36■■□□□ 1.33
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CTDP1-208ENST00000613122 POLD1P28340 1107 aa23.36■■□□□ 1.33
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CTDP1-208ENST00000613122 CENPHQ9H3R5 247 aa23.36■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.36■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 SAMM50Q9Y512 469 aa23.35■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 AMPD3Q01432 767 aa23.35■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 MICU3Q86XE3 530 aa23.35■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 TSPYL1Q9H0U9 437 aa23.35■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.35■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 ATP2B3Q16720 1220 aa23.35■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 TAX1BP1Q86VP1 789 aa23.35■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 CYP7A1P22680 504 aa23.34■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 HMG20BQ9P0W2 317 aa23.34■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 CLEC11AQ9Y240 323 aa23.34■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 NBPF14Q5TI25 921 aa23.34■■□□□ 1.33
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