RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 C8orf34Q49A92 452 aa22.23■■□□□ 1.15
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USP3-AS1-208ENST00000560962 PALLDQ8WX93 1383 aa22.22■■□□□ 1.15
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATP8B2P98198 1209 aa22.22■■□□□ 1.15
USP3-AS1-208ENST00000560962 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.21■■□□□ 1.15
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGKV5-2P06315 115 aa22.21■■□□□ 1.15
USP3-AS1-208ENST00000560962 SIK1P57059 783 aa22.21■■□□□ 1.15
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.21■■□□□ 1.15
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USP3-AS1-208ENST00000560962 APBB1O00213 710 aa22.2■■□□□ 1.14
USP3-AS1-208ENST00000560962 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.2■■□□□ 1.14
USP3-AS1-208ENST00000560962 BCL11AQ9H165 835 aa22.2■■□□□ 1.14
USP3-AS1-208ENST00000560962 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
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USP3-AS1-208ENST00000560962 UTYO14607 1347 aa22.19■■□□□ 1.14
USP3-AS1-208ENST00000560962 MYD88Q99836 296 aa22.19■■□□□ 1.14
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USP3-AS1-208ENST00000560962 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.18■■□□□ 1.14
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.18■■□□□ 1.14
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USP3-AS1-208ENST00000560962 GRM8O00222 908 aa22.17■■□□□ 1.14
USP3-AS1-208ENST00000560962 GCKRQ14397 625 aa22.16■■□□□ 1.14
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM182BQ5T319 152 aa22.16■■□□□ 1.14
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USP3-AS1-208ENST00000560962 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.15■■□□□ 1.14
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USP3-AS1-208ENST00000560962 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.15■■□□□ 1.14
USP3-AS1-208ENST00000560962 BTAF1O14981 1849 aa22.13■■□□□ 1.13
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USP3-AS1-208ENST00000560962 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.13■■□□□ 1.13
USP3-AS1-208ENST00000560962 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
USP3-AS1-208ENST00000560962 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.13■■□□□ 1.13
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USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.13■■□□□ 1.13
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
USP3-AS1-208ENST00000560962 SBF2Q86WG5 1849 aa22.12■■□□□ 1.13
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.12■■□□□ 1.13
USP3-AS1-208ENST00000560962 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
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USP3-AS1-208ENST00000560962 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.09■■□□□ 1.13
USP3-AS1-208ENST00000560962 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
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USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A087WZG4 1122 aa22.07■■□□□ 1.12
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USP3-AS1-208ENST00000560962 SEC24BO95487 1268 aa22.07■■□□□ 1.12
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USP3-AS1-208ENST00000560962 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
USP3-AS1-208ENST00000560962 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.06■■□□□ 1.12
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARXQ96QS3 562 aa22.06■■□□□ 1.12
USP3-AS1-208ENST00000560962 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.06■■□□□ 1.12
USP3-AS1-208ENST00000560962 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
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USP3-AS1-208ENST00000560962 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.05■■□□□ 1.12
USP3-AS1-208ENST00000560962 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
USP3-AS1-208ENST00000560962 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.05■■□□□ 1.12
USP3-AS1-208ENST00000560962 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.05■■□□□ 1.12
USP3-AS1-208ENST00000560962 HLFQ16534 295 aa22.04■■□□□ 1.12
USP3-AS1-208ENST00000560962 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.04■■□□□ 1.12
USP3-AS1-208ENST00000560962 LY75O60449 1722 aa22.04■■□□□ 1.12
USP3-AS1-208ENST00000560962 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.03■■□□□ 1.12
USP3-AS1-208ENST00000560962 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.03■■□□□ 1.12
USP3-AS1-208ENST00000560962 RAB11FIP3O75154 756 aa22.02■■□□□ 1.12
USP3-AS1-208ENST00000560962 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
USP3-AS1-208ENST00000560962 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
USP3-AS1-208ENST00000560962 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
USP3-AS1-208ENST00000560962 RXRBP28702 533 aa22.01■■□□□ 1.11
USP3-AS1-208ENST00000560962 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
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