RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556067.1

ATL1-208, Transcript of atlastin GTPase 1, human

TSL 4

Gene ATL1, Length 550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATL1-208	ENST00000556067	TSC1	Q92574	1164 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ATL1-208	ENST00000556067	ORAI2	Q96SN7	254 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ATL1-208	ENST00000556067	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ATL1-208	ENST00000556067	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ATL1-208	ENST00000556067	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATL1-208	ENST00000556067	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATL1-208	ENST00000556067	SLC19A1	P41440	591 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATL1-208	ENST00000556067	AMPH	P49418	695 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATL1-208	ENST00000556067	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
ATL1-208	ENST00000556067	PRR7	Q8TB68	274 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATL1-208	ENST00000556067	RUNDC1	Q96C34	613 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATL1-208	ENST00000556067	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATL1-208	ENST00000556067	POLK	Q9UBT6	870 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATL1-208	ENST00000556067	USP31	Q70CQ4	1352 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATL1-208	ENST00000556067	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATL1-208	ENST00000556067	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATL1-208	ENST00000556067	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ATL1-208	ENST00000556067	AKAP12	Q02952	1782 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ATL1-208	ENST00000556067	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ATL1-208	ENST00000556067	JUND	P17535	347 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ATL1-208	ENST00000556067	QPCT	Q16769	361 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ATL1-208	ENST00000556067	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ATL1-208	ENST00000556067	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ATL1-208	ENST00000556067	SLAIN2	Q9P270	581 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ATL1-208	ENST00000556067	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.24
ATL1-208	ENST00000556067	SSH2	Q76I76	1423 aa		7.27	□□□□□ -1.24
ATL1-208	ENST00000556067	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	GJA5	P36382	358 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	MMP16	P51512	607 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	STRC	Q7RTU9	1775 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	MST1R	Q04912	1400 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	KIF1A	Q12756	1690 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	APAF1	O14727	1248 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	SBNO1	A3KN83	1393 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	FLT4	P35916	1363 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	CFAP99	D6REC4	459 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	FBLN1	P23142	703 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	ARHGEF10	O15013	1369 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	IL13	P35225	146 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	SPRYD7	Q5W111	196 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	GC	P02774	474 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	PRKAR2B	P31323	418 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	BRINP3	Q76B58	766 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	RTL1	A6NKG5	1358 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067		E9PSI1	815 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	TOM1	O60784	492 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	LILRB3	O75022	631 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	HMOX1	P09601	288 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	HOXC9	P31274	260 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	RIPK4	P57078	832 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	FOXC1	Q12948	553 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	CCDC27	Q2M243	656 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	WDR63	Q8IWG1	891 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	IP6K1	Q92551	441 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		7.21	□□□□□ -1.25
ATL1-208	ENST00000556067	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
ATL1-208	ENST00000556067	CTH	P32929	405 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ATL1-208	ENST00000556067	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
ATL1-208	ENST00000556067	RPIA	P49247	311 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ATL1-208	ENST00000556067	PTPRN	Q16849	979 aa		7.21	□□□□□ -1.26

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