RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549107.5

PTPRR-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, human

TSL 2

Gene PTPRR, Length 862 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRR-208	ENST00000549107	ATRN	O75882	1429 aa		14.03	□□□□□ -0.16
PTPRR-208	ENST00000549107	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		14.02	□□□□□ -0.16
PTPRR-208	ENST00000549107	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	14.02	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	ATP8B2	P98198	1209 aa		14.02	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		14.02	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		14.02	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		14.02	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	LNPK	Q9C0E8	428 aa		14.02	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	14.01	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107		A0A0G2JS52	829 aa		14.01	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	STARD3NL	O95772	234 aa		14.01	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	IGKV5-2	P06315	115 aa		14.01	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	MYT1	Q01538	1121 aa		14.01	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	FAM161A	Q3B820	660 aa		14.01	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		14.01	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	MYD88	Q99836	296 aa		14.01	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	UTY	O14607	1347 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	GRM8	O00222	908 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	C8orf34	Q49A92	452 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	POTEA	Q6S8J7	498 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	GCKR	Q14397	625 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	SSH3	Q8TE77	659 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	NHS	Q6T4R5	1651 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	PALLD	Q8WX93	1383 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	KCNQ2	O43526	872 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	POLA2	Q14181	598 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	RREB1	Q92766	1687 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	MTX1	Q13505	466 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	SUCLG2	Q96I99	432 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRR-208	ENST00000549107	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	APBB1	O00213	710 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	SRGAP3	O43295	1099 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	SIK1	P57059	783 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	ATP6V1A	P38606	617 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	KAZALD1	Q96I82	304 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	BTAF1	O14981	1849 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	COL15A1	P39059	1388 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	ITPK1	Q13572	414 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107		A0A087WZG4	1122 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	RAB11FIP3	O75154	756 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	SBF2	Q86WG5	1849 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107		H7C1W4	665 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	CASP7	P55210	303 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	TCIRG1	Q13488	830 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	FAM182B	Q5T319	152 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	BCL11A	Q9H165	835 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PTPRR-208	ENST00000549107	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	ARX	Q96QS3	562 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19

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