RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PACSIN3-211ENST00000539589 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PACSIN3-211ENST00000539589 RIC3Q7Z5B4 369 aa25.05■■□□□ 1.6
PACSIN3-211ENST00000539589 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
PACSIN3-211ENST00000539589 ATRNO75882 1429 aa25.05■■□□□ 1.6
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa25.05■■□□□ 1.6
PACSIN3-211ENST00000539589 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
PACSIN3-211ENST00000539589 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.04■■□□□ 1.6
PACSIN3-211ENST00000539589 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PACSIN3-211ENST00000539589 ALDH1L1O75891 902 aa25.04■■□□□ 1.6
PACSIN3-211ENST00000539589 IGKV5-2P06315 115 aa25.04■■□□□ 1.6
PACSIN3-211ENST00000539589 TTC22Q5TAA0 569 aa25.04■■□□□ 1.6
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNQ2O43526 872 aa25.03■■□□□ 1.6
PACSIN3-211ENST00000539589 CDC45O75419 566 aa25.03■■□□□ 1.6
PACSIN3-211ENST00000539589 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP8B2P98198 1209 aa25.03■■□□□ 1.6
PACSIN3-211ENST00000539589 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa25.03■■□□□ 1.6
PACSIN3-211ENST00000539589 APBB1O00213 710 aa25.03■■□□□ 1.6
PACSIN3-211ENST00000539589 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
PACSIN3-211ENST00000539589 RBM25P49756 843 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
PACSIN3-211ENST00000539589 TTLL7Q6ZT98 887 aa25.03■■□□□ 1.6
PACSIN3-211ENST00000539589 LINS1Q8NG48 757 aa25.03■■□□□ 1.6
PACSIN3-211ENST00000539589 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A0G2JS52 829 aa25.02■■□□□ 1.6
PACSIN3-211ENST00000539589 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PACSIN3-211ENST00000539589 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PACSIN3-211ENST00000539589 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PACSIN3-211ENST00000539589 TBC1D2Q9BYX2 928 aa25.02■■□□□ 1.6
PACSIN3-211ENST00000539589 BCL11AQ9H165 835 aa25.02■■□□□ 1.6
PACSIN3-211ENST00000539589 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa25.01■■□□□ 1.59
PACSIN3-211ENST00000539589 MYD88Q99836 296 aa25■■□□□ 1.59
PACSIN3-211ENST00000539589 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
PACSIN3-211ENST00000539589 PLBD2Q8NHP8 589 aa24.99■■□□□ 1.59
PACSIN3-211ENST00000539589 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
PACSIN3-211ENST00000539589 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.98■■□□□ 1.59
PACSIN3-211ENST00000539589 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
PACSIN3-211ENST00000539589 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
PACSIN3-211ENST00000539589 STARD3NLO95772 234 aa24.97■■□□□ 1.59
PACSIN3-211ENST00000539589 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa24.97■■□□□ 1.59
PACSIN3-211ENST00000539589 UTYO14607 1347 aa24.97■■□□□ 1.59
PACSIN3-211ENST00000539589 PTF1AQ7RTS3 328 aa24.96■■□□□ 1.59
PACSIN3-211ENST00000539589 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM182BQ5T319 152 aa24.96■■□□□ 1.59
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRCC1Q9C099 1032 aa24.96■■□□□ 1.59
PACSIN3-211ENST00000539589 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.59
PACSIN3-211ENST00000539589 GRM8O00222 908 aa24.95■■□□□ 1.58
PACSIN3-211ENST00000539589 NEXNQ0ZGT2 675 aa24.95■■□□□ 1.58
PACSIN3-211ENST00000539589 NFKBIBQ15653 356 aa24.95■■□□□ 1.58
PACSIN3-211ENST00000539589 OSBPL3Q9H4L5 887 aa24.95■■□□□ 1.58
PACSIN3-211ENST00000539589 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
PACSIN3-211ENST00000539589 SBF2Q86WG5 1849 aa24.94■■□□□ 1.58
PACSIN3-211ENST00000539589 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
PACSIN3-211ENST00000539589 GCKRQ14397 625 aa24.94■■□□□ 1.58
PACSIN3-211ENST00000539589 KAZALD1Q96I82 304 aa24.94■■□□□ 1.58
PACSIN3-211ENST00000539589 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa24.93■■□□□ 1.58
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa24.93■■□□□ 1.58
PACSIN3-211ENST00000539589 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa24.93■■□□□ 1.58
PACSIN3-211ENST00000539589 PALLDQ8WX93 1383 aa24.93■■□□□ 1.58
PACSIN3-211ENST00000539589 BTAF1O14981 1849 aa24.93■■□□□ 1.58
PACSIN3-211ENST00000539589 CASC1Q6TDU7 716 aa24.93■■□□□ 1.58
PACSIN3-211ENST00000539589 SSH3Q8TE77 659 aa24.93■■□□□ 1.58
PACSIN3-211ENST00000539589 ZBTB3Q9H5J0 574 aa24.93■■□□□ 1.58
PACSIN3-211ENST00000539589 NHSQ6T4R5 1651 aa24.92■■□□□ 1.58
PACSIN3-211ENST00000539589 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa24.92■■□□□ 1.58
PACSIN3-211ENST00000539589 SDSP20132 328 aa24.92■■□□□ 1.58
PACSIN3-211ENST00000539589 PDE1AP54750 535 aa24.92■■□□□ 1.58
PACSIN3-211ENST00000539589 SIK1P57059 783 aa24.92■■□□□ 1.58
PACSIN3-211ENST00000539589 SUCLG2Q96I99 432 aa24.92■■□□□ 1.58
PACSIN3-211ENST00000539589 ITPK1Q13572 414 aa24.91■■□□□ 1.58
PACSIN3-211ENST00000539589 POLA2Q14181 598 aa24.91■■□□□ 1.58
PACSIN3-211ENST00000539589 SEPT12Q8IYM1 358 aa24.91■■□□□ 1.58
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP6V1AP38606 617 aa24.9■■□□□ 1.58
PACSIN3-211ENST00000539589 HSCBQ8IWL3 235 aa24.9■■□□□ 1.58
PACSIN3-211ENST00000539589 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PACSIN3-211ENST00000539589 RREB1Q92766 1687 aa24.9■■□□□ 1.58
PACSIN3-211ENST00000539589 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
PACSIN3-211ENST00000539589 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
PACSIN3-211ENST00000539589 SNX21Q969T3 373 aa24.89■■□□□ 1.57
PACSIN3-211ENST00000539589 BRWD3Q6RI45 1802 aa24.89■■□□□ 1.57
PACSIN3-211ENST00000539589 RAB11FIP3O75154 756 aa24.88■■□□□ 1.57
PACSIN3-211ENST00000539589 MTX1Q13505 466 aa24.88■■□□□ 1.57
PACSIN3-211ENST00000539589 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
PACSIN3-211ENST00000539589 ANTXR1Q9H6X2 564 aa24.88■■□□□ 1.57
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF831Q5JPB2 1677 aa24.88■■□□□ 1.57
PACSIN3-211ENST00000539589 SRGAP3O43295 1099 aa24.88■■□□□ 1.57
PACSIN3-211ENST00000539589 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
PACSIN3-211ENST00000539589 HDAC5Q9UQL6 1122 aa24.88■■□□□ 1.57
PACSIN3-211ENST00000539589 SALL3Q9BXA9 1300 aa24.87■■□□□ 1.57
PACSIN3-211ENST00000539589 EP400Q96L91 3159 aa24.87■■□□□ 1.57
PACSIN3-211ENST00000539589 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
PACSIN3-211ENST00000539589 NUP98P52948 1817 aa24.86■■□□□ 1.57
PACSIN3-211ENST00000539589 MX1P20591 662 aa24.86■■□□□ 1.57
PACSIN3-211ENST00000539589 CASP7P55210 303 aa24.86■■□□□ 1.57
PACSIN3-211ENST00000539589 EPHA10Q5JZY3 1008 aa24.86■■□□□ 1.57
PACSIN3-211ENST00000539589 KIF2CQ99661 725 aa24.85■■□□□ 1.57
PACSIN3-211ENST00000539589 SURF6O75683 361 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
PACSIN3-211ENST00000539589 DEKP35659 375 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
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