RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536072.6

EDC4-202, Transcript of enhancer of mRNA decapping 4, humanhuman

TSL 2

Gene EDC4, Length 2,375 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4-202ENST00000536072 ABCA3Q99758 1704 aa20.29■□□□□ 0.84
EDC4-202ENST00000536072 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
EDC4-202ENST00000536072 GSE1Q14687 1217 aa20.29■□□□□ 0.84
EDC4-202ENST00000536072 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa20.29■□□□□ 0.84
EDC4-202ENST00000536072 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
EDC4-202ENST00000536072 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
EDC4-202ENST00000536072 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
EDC4-202ENST00000536072 GCKRQ14397 625 aa20.27■□□□□ 0.84
EDC4-202ENST00000536072 GLI3P10071 1580 aa20.26■□□□□ 0.83
EDC4-202ENST00000536072 ERVV-2B6SEH9 535 aa20.25■□□□□ 0.83
EDC4-202ENST00000536072 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
EDC4-202ENST00000536072 NHSL1Q5SYE7 1610 aa20.25■□□□□ 0.83
EDC4-202ENST00000536072 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
EDC4-202ENST00000536072 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
EDC4-202ENST00000536072 ANO2Q9NQ90 1003 aa20.24■□□□□ 0.83
EDC4-202ENST00000536072 EPHA10Q5JZY3 1008 aa20.23■□□□□ 0.83
EDC4-202ENST00000536072 IL25Q9H293 177 aa20.23■□□□□ 0.83
EDC4-202ENST00000536072 NBPF26B4DH59 902 aa20.23■□□□□ 0.83
EDC4-202ENST00000536072 MCM4P33991 863 aa20.23■□□□□ 0.83
EDC4-202ENST00000536072 NBPF14Q5TI25 921 aa20.23■□□□□ 0.83
EDC4-202ENST00000536072 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
EDC4-202ENST00000536072 ERC1Q8IUD2 1116 aa20.23■□□□□ 0.83
EDC4-202ENST00000536072 NBPF15Q8N660 670 aa20.23■□□□□ 0.83
EDC4-202ENST00000536072 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.22■□□□□ 0.83
EDC4-202ENST00000536072 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
EDC4-202ENST00000536072 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
EDC4-202ENST00000536072 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
EDC4-202ENST00000536072 SIL1Q9H173 461 aa20.22■□□□□ 0.83
EDC4-202ENST00000536072 SASH1O94885 1247 aa20.21■□□□□ 0.83
EDC4-202ENST00000536072 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.836e-7■□□□□ 10.5
EDC4-202ENST00000536072 KLHDC4Q8TBB5 520 aa20.21■□□□□ 0.83
EDC4-202ENST00000536072 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
EDC4-202ENST00000536072 TTC41PQ6P2S7 1318 aa20.21■□□□□ 0.83
EDC4-202ENST00000536072 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
EDC4-202ENST00000536072 AACSQ86V21 672 aa20.2■□□□□ 0.82
EDC4-202ENST00000536072 CNTROBQ8N137 903 aa20.2■□□□□ 0.82
EDC4-202ENST00000536072 BTG4Q9NY30 223 aa20.2■□□□□ 0.82
EDC4-202ENST00000536072 PALD1Q9ULE6 856 aa20.2■□□□□ 0.82
EDC4-202ENST00000536072 SHANK3Q9BYB0 1731 aa20.2■□□□□ 0.82
EDC4-202ENST00000536072 ST18O60284 1047 aa20.2■□□□□ 0.82
EDC4-202ENST00000536072 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
EDC4-202ENST00000536072 A1BGP04217 495 aa20.2■□□□□ 0.82
EDC4-202ENST00000536072 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.2■□□□□ 0.82
EDC4-202ENST00000536072 LAMB4A4D0S4 1761 aa20.19■□□□□ 0.82
EDC4-202ENST00000536072 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa20.19■□□□□ 0.82
EDC4-202ENST00000536072 KCPQ6ZWJ8 1503 aa20.19■□□□□ 0.82
EDC4-202ENST00000536072 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
EDC4-202ENST00000536072 ECHDC1Q9NTX5 307 aa20.19■□□□□ 0.82
EDC4-202ENST00000536072 MCCP23508 829 aa20.18■□□□□ 0.82
EDC4-202ENST00000536072 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.18■□□□□ 0.82
EDC4-202ENST00000536072 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa20.18■□□□□ 0.82
EDC4-202ENST00000536072 A0A087WZG4 1122 aa20.17■□□□□ 0.82
EDC4-202ENST00000536072 RAB3GAP1Q15042 981 aa20.17■□□□□ 0.82
EDC4-202ENST00000536072 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
EDC4-202ENST00000536072 ERBB4Q15303 1308 aa20.17■□□□□ 0.82
EDC4-202ENST00000536072 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
EDC4-202ENST00000536072 UBR2Q8IWV8 1755 aa20.16■□□□□ 0.82
EDC4-202ENST00000536072 NEK4P51957 841 aa20.16■□□□□ 0.82
EDC4-202ENST00000536072 GPATCH3Q96I76 525 aa20.16■□□□□ 0.82
EDC4-202ENST00000536072 AK9Q5TCS8 1911 aa20.16■□□□□ 0.82
EDC4-202ENST00000536072 SGSM2O43147 1006 aa20.15■□□□□ 0.82
EDC4-202ENST00000536072 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
EDC4-202ENST00000536072 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
EDC4-202ENST00000536072 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
EDC4-202ENST00000536072 TMOD3Q9NYL9 352 aa20.15■□□□□ 0.82
EDC4-202ENST00000536072 PAPPAQ13219 1627 aa20.14■□□□□ 0.82
EDC4-202ENST00000536072 TNS2Q63HR2 1409 aa20.14■□□□□ 0.81
EDC4-202ENST00000536072 CASP7P55210 303 aa20.14■□□□□ 0.81
EDC4-202ENST00000536072 ANAPC15P60006 121 aa20.14■□□□□ 0.81
EDC4-202ENST00000536072 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa20.13■□□□□ 0.81
EDC4-202ENST00000536072 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
EDC4-202ENST00000536072 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.13■□□□□ 0.81
EDC4-202ENST00000536072 SSFA2P28290 1259 aa20.13■□□□□ 0.81
EDC4-202ENST00000536072 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
EDC4-202ENST00000536072 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
EDC4-202ENST00000536072 COPRSQ9NQ92 184 aa20.12■□□□□ 0.81
EDC4-202ENST00000536072 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa20.12■□□□□ 0.81
EDC4-202ENST00000536072 ASAP1Q9ULH1 1129 aa20.12■□□□□ 0.81
EDC4-202ENST00000536072 HSPA4P34932 840 aa20.11■□□□□ 0.81
EDC4-202ENST00000536072 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
EDC4-202ENST00000536072 PIGBQ92521 554 aa20.11■□□□□ 0.81
EDC4-202ENST00000536072 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
EDC4-202ENST00000536072 COL15A1P39059 1388 aa20.11■□□□□ 0.81
EDC4-202ENST00000536072 RAD50Q92878 1312 aa20.11■□□□□ 0.81
EDC4-202ENST00000536072 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.1■□□□□ 0.81
EDC4-202ENST00000536072 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
EDC4-202ENST00000536072 LMBR1LQ6UX01 489 aa20.1■□□□□ 0.81
EDC4-202ENST00000536072 EVI5LQ96CN4 794 aa20.1■□□□□ 0.81
EDC4-202ENST00000536072 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
EDC4-202ENST00000536072 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
EDC4-202ENST00000536072 H7C1W4 665 aa20.09■□□□□ 0.81
EDC4-202ENST00000536072 TRAK2O60296 914 aa20.09■□□□□ 0.81
EDC4-202ENST00000536072 GBP4Q96PP9 640 aa20.09■□□□□ 0.81
EDC4-202ENST00000536072 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa20.09■□□□□ 0.81
EDC4-202ENST00000536072 IL17RAQ96F46 866 aa20.09■□□□□ 0.81
EDC4-202ENST00000536072 BOLA2Q9H3K6 86 aa20.09■□□□□ 0.81
EDC4-202ENST00000536072 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
EDC4-202ENST00000536072 FOXO4P98177 505 aa20.08■□□□□ 0.81
EDC4-202ENST00000536072 TFCP2Q12800 502 aa20.08■□□□□ 0.81
EDC4-202ENST00000536072 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.08■□□□□ 0.81
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