RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529559.1

USP17L1-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 17-like family member 1, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene USP17L1, Length 1,593 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L1-201ENST00000529559 TJP1Q07157 1748 aa14.6□□□□□ -0.07
USP17L1-201ENST00000529559 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa14.6□□□□□ -0.07
USP17L1-201ENST00000529559 GCKRQ14397 625 aa14.6□□□□□ -0.07
USP17L1-201ENST00000529559 BMP2KLQ5H9B9 411 aa14.6□□□□□ -0.07
USP17L1-201ENST00000529559 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa14.6□□□□□ -0.07
USP17L1-201ENST00000529559 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
USP17L1-201ENST00000529559 MYD88Q99836 296 aa14.6□□□□□ -0.07
USP17L1-201ENST00000529559 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
USP17L1-201ENST00000529559 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
USP17L1-201ENST00000529559 DNAJC10Q8IXB1 793 aa14.59□□□□□ -0.07
USP17L1-201ENST00000529559 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
USP17L1-201ENST00000529559 COL15A1P39059 1388 aa14.58□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 SRGAP3O43295 1099 aa14.57□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa14.57□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 SLC4A9Q96Q91 983 aa14.57□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 LRRCC1Q9C099 1032 aa14.57□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa14.57□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 RAB11FIP3O75154 756 aa14.56□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 TTLL7Q6ZT98 887 aa14.56□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 ZNF831Q5JPB2 1677 aa14.56□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 APBB1O00213 710 aa14.55□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa14.55□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 KAZALD1Q96I82 304 aa14.55□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 SUCLG2Q96I99 432 aa14.55□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 RREB1Q92766 1687 aa14.54□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 ACSBG1Q96GR2 724 aa14.54□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 OSBPL3Q9H4L5 887 aa14.54□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 ATRNO75882 1429 aa14.54□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 AFF2P51816 1311 aa14.54□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 SURF6O75683 361 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 TTC22Q5TAA0 569 aa14.53□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 SALL3Q9BXA9 1300 aa14.53□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa14.52□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 CASP7P55210 303 aa14.52□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 KIF6Q6ZMV9 814 aa14.52□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 CCDC191Q8NCU4 936 aa14.52□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 KIF1BPQ96EK5 621 aa14.52□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 ZBTB3Q9H5J0 574 aa14.52□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
USP17L1-201ENST00000529559 PALLDQ8WX93 1383 aa14.52□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 A0A087WZG4 1122 aa14.51□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 H7C1W4 665 aa14.51□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 SEC24BO95487 1268 aa14.51□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa14.51□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 NHSQ6T4R5 1651 aa14.51□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa14.51□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa14.51□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 PDE1AP54750 535 aa14.51□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 SIK1P57059 783 aa14.51□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 TCIRG1Q13488 830 aa14.51□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 RHPN1Q8TCX5 695 aa14.51□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 ISCA1Q9BUE6 129 aa14.51□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa14.5□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa14.5□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 A0A0G2JS52 829 aa14.5□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 KCNQ2O43526 872 aa14.5□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 MYT1Q01538 1121 aa14.5□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 ERC1Q8IUD2 1116 aa14.5□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 STAP2Q9UGK3 403 aa14.5□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa14.5□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 AOX1Q06278 1338 aa14.5□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 MX1P20591 662 aa14.49□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 ATP6V1AP38606 617 aa14.49□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 CCDC87Q9NVE4 849 aa14.49□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 NUP98P52948 1817 aa14.48□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 CDC45O75419 566 aa14.48□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa14.48□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 EPHA10Q5JZY3 1008 aa14.48□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 BTAF1O14981 1849 aa14.48□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 ERVV-1B6SEH8 477 aa14.47□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 CRKLP46109 303 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 SBF2Q86WG5 1849 aa14.47□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 EIF5P55010 431 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 ITPK1Q13572 414 aa14.47□□□□□ -0.09
USP17L1-201ENST00000529559 DDRGK1Q96HY6 314 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms