RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496565.5

LPIN3-204, Transcript of lipin 3, human

TSL 3

Gene LPIN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LPIN3-204	ENST00000496565	MYL6B	P14649	208 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	SIK1	P57059	783 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	PROSER3	Q2NL68	480 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	NBPF14	Q5TI25	921 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	NBPF15	Q8N660	670 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	SSH3	Q8TE77	659 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	GCKR	Q14397	625 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	PALLD	Q8WX93	1383 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	A1BG	P04217	495 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	ATP6V1A	P38606	617 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	TCIRG1	Q13488	830 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	POLA2	Q14181	598 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	AK7	Q96M32	723 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	NHS	Q6T4R5	1651 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565		A0A0G2JS52	829 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	ANXA1	P04083	346 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	IGKV5-2	P06315	115 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	MYT1	Q01538	1121 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	FBXO3	Q9UK99	471 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	RREB1	Q92766	1687 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565		H7C1W4	665 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	FAM161A	Q3B820	660 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	PARP10	Q53GL7	1025 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	MYD88	Q99836	296 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	TJP1	Q07157	1748 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	SBF2	Q86WG5	1849 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	ADRA2B	P18089	450 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	BACH2	Q9BYV9	841 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	AOX1	Q06278	1338 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	SRGAP3	O43295	1099 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	RPS6KA4	O75676	772 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	RXRB	P28702	533 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	TICAM2	Q86XR7	235 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	COPRS	Q9NQ92	184 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	LY75	O60449	1722 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	BTAF1	O14981	1849 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	PLSCR1	O15162	318 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	KCNQ2	O43526	872 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	PDE4A	P27815	886 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	CASP7	P55210	303 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	RGS3	P49796	1198 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	11.6	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	ITPK1	Q13572	414 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	STAP2	Q9UGK3	403 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
LPIN3-204	ENST00000496565	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms