RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 CERKQ8TCT0 537 aa23.53■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 ATG3Q9NT62 314 aa23.53■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 MTX1Q13505 466 aa23.52■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.52■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.52■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 UNC5CLQ8IV45 518 aa23.52■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 PLBD2Q8NHP8 589 aa23.52■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 NEURL1BA8MQ27 555 aa23.51■■□□□ 1.35
SYF2-204ENST00000476231 APBB1O00213 710 aa23.51■■□□□ 1.35
SYF2-204ENST00000476231 MYD88Q99836 296 aa23.51■■□□□ 1.35
SYF2-204ENST00000476231 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa23.51■■□□□ 1.35
SYF2-204ENST00000476231 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SYF2-204ENST00000476231 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SYF2-204ENST00000476231 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SYF2-204ENST00000476231 SNX21Q969T3 373 aa23.51■■□□□ 1.35
SYF2-204ENST00000476231 LRRCC1Q9C099 1032 aa23.51■■□□□ 1.35
SYF2-204ENST00000476231 BCL11AQ9H165 835 aa23.51■■□□□ 1.35
SYF2-204ENST00000476231 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SYF2-204ENST00000476231 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.5■■□□□ 1.35
SYF2-204ENST00000476231 SRGAP3O43295 1099 aa23.5■■□□□ 1.35
SYF2-204ENST00000476231 A1BGP04217 495 aa23.49■■□□□ 1.35
SYF2-204ENST00000476231 RAB11FIP3O75154 756 aa23.49■■□□□ 1.35
SYF2-204ENST00000476231 GCKRQ14397 625 aa23.49■■□□□ 1.35
SYF2-204ENST00000476231 NGLY1Q96IV0 654 aa23.48■■□□□ 1.35
SYF2-204ENST00000476231 TTC22Q5TAA0 569 aa23.47■■□□□ 1.35
SYF2-204ENST00000476231 C8orf37Q96NL8 207 aa23.47■■□□□ 1.35
SYF2-204ENST00000476231 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.47■■□□□ 1.35
SYF2-204ENST00000476231 BCL9LQ86UU0 1499 aa23.47■■□□□ 1.35
SYF2-204ENST00000476231 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SYF2-204ENST00000476231 VPS72Q15906 364 aa23.47■■□□□ 1.35
SYF2-204ENST00000476231 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa23.46■■□□□ 1.35
SYF2-204ENST00000476231 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SYF2-204ENST00000476231 OSBPL3Q9H4L5 887 aa23.46■■□□□ 1.35
SYF2-204ENST00000476231 SURF6O75683 361 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
SYF2-204ENST00000476231 STARD3NLO95772 234 aa23.45■■□□□ 1.35
SYF2-204ENST00000476231 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
SYF2-204ENST00000476231 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
SYF2-204ENST00000476231 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
SYF2-204ENST00000476231 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
SYF2-204ENST00000476231 SUCLG2Q96I99 432 aa23.45■■□□□ 1.35
SYF2-204ENST00000476231 CDC45O75419 566 aa23.45■■□□□ 1.34
SYF2-204ENST00000476231 DNAJC10Q8IXB1 793 aa23.45■■□□□ 1.34
SYF2-204ENST00000476231 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SYF2-204ENST00000476231 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SYF2-204ENST00000476231 HSCBQ8IWL3 235 aa23.44■■□□□ 1.34
SYF2-204ENST00000476231 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SYF2-204ENST00000476231 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.43■■□□□ 1.34
SYF2-204ENST00000476231 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.43■■□□□ 1.34
SYF2-204ENST00000476231 COL15A1P39059 1388 aa23.43■■□□□ 1.34
SYF2-204ENST00000476231 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SYF2-204ENST00000476231 KAZALD1Q96I82 304 aa23.43■■□□□ 1.34
SYF2-204ENST00000476231 SALL3Q9BXA9 1300 aa23.43■■□□□ 1.34
SYF2-204ENST00000476231 CHMP5Q9NZZ3 219 aa23.42■■□□□ 1.34
SYF2-204ENST00000476231 KIF1BPQ96EK5 621 aa23.41■■□□□ 1.34
SYF2-204ENST00000476231 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SYF2-204ENST00000476231 PDE1AP54750 535 aa23.41■■□□□ 1.34
SYF2-204ENST00000476231 RHPN1Q8TCX5 695 aa23.4■■□□□ 1.34
SYF2-204ENST00000476231 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa23.4■■□□□ 1.34
SYF2-204ENST00000476231 SLC4A9Q96Q91 983 aa23.4■■□□□ 1.34
SYF2-204ENST00000476231 TJP1Q07157 1748 aa23.39■■□□□ 1.33
SYF2-204ENST00000476231 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.39■■□□□ 1.33
SYF2-204ENST00000476231 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SYF2-204ENST00000476231 MX1P20591 662 aa23.38■■□□□ 1.33
SYF2-204ENST00000476231 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SYF2-204ENST00000476231 STAP2Q9UGK3 403 aa23.38■■□□□ 1.33
SYF2-204ENST00000476231 A0A087WZG4 1122 aa23.38■■□□□ 1.33
SYF2-204ENST00000476231 AOX1Q06278 1338 aa23.37■■□□□ 1.33
SYF2-204ENST00000476231 ERC1Q8IUD2 1116 aa23.37■■□□□ 1.33
SYF2-204ENST00000476231 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.37■■□□□ 1.33
SYF2-204ENST00000476231 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SYF2-204ENST00000476231 USP21Q9UK80 565 aa23.37■■□□□ 1.33
SYF2-204ENST00000476231 KIF2CQ99661 725 aa23.36■■□□□ 1.33
SYF2-204ENST00000476231 SDSP20132 328 aa23.36■■□□□ 1.33
SYF2-204ENST00000476231 CASP7P55210 303 aa23.36■■□□□ 1.33
SYF2-204ENST00000476231 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.36■■□□□ 1.33
SYF2-204ENST00000476231 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa23.36■■□□□ 1.33
SYF2-204ENST00000476231 CCDC191Q8NCU4 936 aa23.36■■□□□ 1.33
SYF2-204ENST00000476231 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.36■■□□□ 1.33
SYF2-204ENST00000476231 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa23.36■■□□□ 1.33
SYF2-204ENST00000476231 H7C1W4 665 aa23.35■■□□□ 1.33
SYF2-204ENST00000476231 DDIT3P35638 169 aa23.35■■□□□ 1.33
SYF2-204ENST00000476231 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
SYF2-204ENST00000476231 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
SYF2-204ENST00000476231 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
SYF2-204ENST00000476231 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
SYF2-204ENST00000476231 HSPA1LP34931 641 aa23.34■■□□□ 1.33
SYF2-204ENST00000476231 EPHA10Q5JZY3 1008 aa23.34■■□□□ 1.33
SYF2-204ENST00000476231 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.33■■□□□ 1.33
SYF2-204ENST00000476231 TCIRG1Q13488 830 aa23.33■■□□□ 1.33
SYF2-204ENST00000476231 ISCA1Q9BUE6 129 aa23.33■■□□□ 1.33
SYF2-204ENST00000476231 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
SYF2-204ENST00000476231 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SYF2-204ENST00000476231 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SYF2-204ENST00000476231 A0A0G2JS52 829 aa23.32■■□□□ 1.32
SYF2-204ENST00000476231 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
SYF2-204ENST00000476231 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.31■■□□□ 1.32
SYF2-204ENST00000476231 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa23.31■■□□□ 1.32
SYF2-204ENST00000476231 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.32
SYF2-204ENST00000476231 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SYF2-204ENST00000476231 CASC1Q6TDU7 716 aa23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.9 ms