RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473298.6

SOGA3-205, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene SOGA3, Length 3,350 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-205ENST00000473298 CCDC83Q8IWF9 413 aa12.15□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 GAS2L3Q86XJ1 694 aa12.14□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa12.14□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 CHMLP26374 656 aa12.14□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 CRB1P82279 1406 aa12.14□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 RABEP1Q15276 862 aa12.14□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 SMIM5Q71RC9 77 aa12.14□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 CHST3Q7LGC8 479 aa12.14□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 TMX3Q96JJ7 454 aa12.14□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 AK9Q5TCS8 1911 aa12.14□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa12.13□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 OVOS2Q6IE36 1432 aa12.13□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 TAF7LQ5H9L4 462 aa12.13□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 AKAP4Q5JQC9 854 aa12.13□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 ARHGEF25Q86VW2 580 aa12.13□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 CERKQ8TCT0 537 aa12.13□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 EPHA10Q5JZY3 1008 aa12.13□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 ACSBG1Q96GR2 724 aa12.13□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 BAG4O95429 457 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 RBM25P49756 843 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 SYNE4Q8N205 404 aa12.13□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 DDX11Q96FC9 970 aa12.13□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 TIMM10P62072 90 aa12.12□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 ZNF790Q6PG37 636 aa12.12□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 TTLL7Q6ZT98 887 aa12.12□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP12.12□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 RASEFQ8IZ41 740 aa12.12□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 SYCE3A1L190 88 aa12.12□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 DDX58O95786 925 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 DDX11L8A8MPP1 907 aa12.11□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 PTH1RQ03431 593 aa12.11□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 BEND3Q5T5X7 828 aa12.11□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 KIF1BPQ96EK5 621 aa12.11□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 ARHGEF10O15013 1369 aa12.11□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 LMBR1LQ6UX01 489 aa12.11□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 CNTROBQ8N137 903 aa12.11□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa12.11□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 PTMAP06454 111 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 CCDC24Q8N4L8 307 aa12.1□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 GRM8O00222 908 aa12.1□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa12.1□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 DCCP43146 1447 aa12.1□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 FAM182BQ5T319 152 aa12.1□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 GRPEL1Q9HAV7 217 aa12.1□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 KIAA0232Q92628 1395 aa12.1□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa12.09□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 CYP27B1O15528 508 aa12.09□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 HAND2P61296 217 aa12.09□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 GUCY1B3Q02153 619 aa12.09□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 ADCK5Q3MIX3 580 aa12.09□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 KSR2Q6VAB6 950 aa12.09□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 ATP10DQ9P241 1426 aa12.09□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 KIF20BQ96Q89 1820 aa12.09□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 TFCP2Q12800 502 aa12.09□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 TAF6LQ9Y6J9 622 aa12.09□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 SNAP23O00161 211 aa12.09□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 FAM89AQ96GI7 184 aa12.09□□□□□ -0.47
SOGA3-205ENST00000473298 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
SOGA3-205ENST00000473298 BICDL1Q6ZP65 573 aa12.08□□□□□ -0.48
SOGA3-205ENST00000473298 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
SOGA3-205ENST00000473298 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa12.08□□□□□ -0.48
SOGA3-205ENST00000473298 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
SOGA3-205ENST00000473298 GOLIM4O00461 696 aa12.08□□□□□ -0.48
SOGA3-205ENST00000473298 WASHC4Q2M389 1173 aa12.08□□□□□ -0.48
SOGA3-205ENST00000473298 AKAP12Q02952 1782 aa12.08□□□□□ -0.48
SOGA3-205ENST00000473298 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
SOGA3-205ENST00000473298 AMOTQ4VCS5 1084 aa12.07□□□□□ -0.48
SOGA3-205ENST00000473298 IFNL2Q8IZJ0 200 aa12.07□□□□□ -0.48
SOGA3-205ENST00000473298 GPATCH3Q96I76 525 aa12.07□□□□□ -0.48
SOGA3-205ENST00000473298 DBNDD2Q9BQY9 259 aa12.07□□□□□ -0.48
SOGA3-205ENST00000473298 SMC3Q9UQE7 1217 aa12.07□□□□□ -0.48
SOGA3-205ENST00000473298 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa12.07□□□□□ -0.48
SOGA3-205ENST00000473298 MON2Q7Z3U7 1717 aa12.07□□□□□ -0.48
SOGA3-205ENST00000473298 RGS12O14924 1447 aa12.07□□□□□ -0.48
SOGA3-205ENST00000473298 LARGE1O95461 756 aa12.07□□□□□ -0.48
SOGA3-205ENST00000473298 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa12.07□□□□□ -0.48
SOGA3-205ENST00000473298 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
SOGA3-205ENST00000473298 TOMM22Q9NS69 142 aa12.07□□□□□ -0.48
SOGA3-205ENST00000473298 ERBB3P21860 1342 aa12.07□□□□□ -0.48
SOGA3-205ENST00000473298 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
SOGA3-205ENST00000473298 AK2P54819 239 aa12.06□□□□□ -0.48
SOGA3-205ENST00000473298 RAB3GAP1Q15042 981 aa12.06□□□□□ -0.48
SOGA3-205ENST00000473298 TNS3Q68CZ2 1445 aa12.06□□□□□ -0.48
SOGA3-205ENST00000473298 SSH2Q76I76 1423 aa12.06□□□□□ -0.48
SOGA3-205ENST00000473298 IGKV5-2P06315 115 aa12.06□□□□□ -0.48
SOGA3-205ENST00000473298 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
SOGA3-205ENST00000473298 ECHDC1Q9NTX5 307 aa12.06□□□□□ -0.48
SOGA3-205ENST00000473298 USP31Q70CQ4 1352 aa12.06□□□□□ -0.48
SOGA3-205ENST00000473298 APPP05067 770 aa12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms