RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	RPIA	P49247	311 aa		6.88	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	PKNOX1	P55347	436 aa		6.88	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	KIAA1024L	P59773	190 aa		6.88	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	6.88	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	IL1RL1	Q01638	556 aa		6.88	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	PRKCD	Q05655	676 aa		6.88	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	PCDH1	Q08174	1060 aa		6.88	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ATP6AP1	Q15904	470 aa		6.88	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		6.88	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		6.88	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	6.88	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	6.88	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		6.88	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	UTS2B	Q765I0	119 aa		6.88	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	IQCH	Q86VS3	1027 aa		6.88	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	PHC2	Q8IXK0	858 aa		6.88	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	CBR4	Q8N4T8	237 aa		6.88	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	6.88	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC7A6	Q92536	515 aa		6.88	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	6.88	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		6.88	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	COX14	Q96I36	57 aa		6.88	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	FOPNL	Q96NB1	174 aa		6.88	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		6.88	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	6.88	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	6.88	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	EHD3	Q9NZN3	535 aa		6.88	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		6.88	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	COPS3	Q9UNS2	423 aa		6.88	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	RGS5	O15539	181 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	CRHR1	P34998	444 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	FOXL2	P58012	376 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	RAB14	P61106	215 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	SH3BP2	P78314	561 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	RGS1	Q08116	209 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ART3	Q13508	389 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	RPE65	Q16518	533 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	SPRED1	Q7Z699	444 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	CEP97	Q8IW35	865 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	OR7G3	Q8NG95	312 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	STON2	Q8WXE9	905 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ST8SIA4	Q92187	359 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ULK4	Q96C45	1275 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	PHF21B	Q96EK2	531 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	STARD5	Q9NSY2	213 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	CDC7	O00311	574 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	FFAR3	O14843	346 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	GPR42	O15529	346 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ZBTB14	O43829	449 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	SERPINE1	P05121	402 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	RBP1	P09455	135 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	HSMCR30	P0CW71	290 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	GIMD1	P0DJR0	217 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	MLN	P12872	115 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	CCL4	P13236	92 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	POU2F1	P14859	743 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	CD53	P19397	219 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	TNNI3	P19429	210 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	GZMK	P49863	264 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	HSD17B7	P56937	341 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	DCDC1	P59894	354 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	IRF9	Q00978	393 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	PRKAA1	Q13131	559 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ZMYND11	Q15326	602 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	GTDC1	Q4AE62	458 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	MAVS	Q7Z434	540 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ZBTB2	Q8N680	514 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	MCFD2	Q8NI22	146 aa		6.87	□□□□□ -1.31

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