RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615579.1

TTC28-AS1_3.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_3, Length 181 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C6orf47O95873 294 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CELA2AP08217 269 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DDX5P17844 614 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KIR3DL1P43629 444 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 STT3AP46977 705 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMEM205Q6UW68 189 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KIRREL2Q6UWL6 708 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMEM107Q6UX40 140 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PROSER1Q86XN7 944 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CLECL1Q8IZS7 167 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 VPS33AQ96AX1 596 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR8D2Q9GZM6 311 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GLIPR2Q9H4G4 154 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ANKRA2Q9H9E1 313 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ADAP2Q9NPF8 381 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SAR1AQ9NR31 198 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 P4HTMQ9NXG6 502 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MAPRE3Q9UPY8 281 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ERVK-19Q9WJR5 959 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CAPN7Q9Y6W3 813 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 A0A1W2PRB8 838 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM234BA2RU67 622 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCDC154A6NI56 674 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HRKO00198 91 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TAF4O00268 1085 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCDC22O60826 627 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CAPNS1P04632 268 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CT62P0C5K7 136 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 COX6A1P12074 109 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CDK9P50750 372 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MANFP55145 182 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TLE3Q04726 772 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KLF10Q13118 480 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PCOLCEQ15113 449 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DEFB109BQ30KR1 87 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BTBD16Q32M84 506 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 METTL21CQ5VZV1 264 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CPZQ66K79 652 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM111BQ6SJ93 734 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GALNT12Q8IXK2 581 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR11G2Q8NGC1 345 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR4A15Q8NGL6 344 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZFP28Q8NHY6 868 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RIT1Q92963 219 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TESCQ96BS2 214 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF681Q96N22 645 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AMDHD1Q96NU7 426 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR52E6Q96RD3 313 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LPAR4Q99677 370 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SNX8Q9Y5X2 465 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IGF2RP11717 2491 aa13.58□□□□□ -0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZFHX4Q86UP3 3567 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SAGE2PA6NJ88 616 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MYO1GB0I1T2 1018 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DYRK3O43781 588 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TBX19O60806 448 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PGRP06401 933 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC35E2P0CK97 266 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PCSK2P16519 638 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CAPN3P20807 821 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MPIP34949 423 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MC3RP41968 323 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C21orf58P58505 322 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DPY19L1Q2PZI1 675 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SPDYE7PQ495Y7 208 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 VPS26BQ4G0F5 336 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C6orf10Q5SRN2 563 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC2A7Q6PXP3 512 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FUNDC1Q8IVP5 155 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 VWA5B2Q8N398 1253 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 POU5F2Q8N7G0 328 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF321PQ8N8H1 164 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR5AK3PQ8NH89 298 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR14A16Q8NHC5 309 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SUN3Q8TAQ9 357 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NCLNQ969V3 563 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 COQ8BQ96D53 544 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SPDL1Q96EA4 605 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF700Q9H0M5 742 aa13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms